在ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/中下载最新的BLAST可执行程序(不要下载源代码`,源码编译非常慢),选择预编译版本,如ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz。如果服务器能联网,可直接用wget下载。或者,下载后用SFTP客户端传输到服务器上。 wgetftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/bl...
输入命令cd C://Users/wanglab1/Desktop,按回车键,目的是找到程序安装的位置。 输入命令cd .\软件\ncbi-blast-2.9.0+-win64\bin\,按回车键,目的是找到程序位置。 构建数据库 输入命令 .\makeblastdb.exe -in C:\Users\wanglab1\Desktop\pepunit.lib -dbtype prot -out lailai 按回车,目的是构建数据库...
在生物信息学,BLAST(基本的局部比对搜索工具)是一种算法,用于比较生物的序列信息,诸如蛋白质的氨基酸序列、DNA或RNA核苷酸序列。BLAST搜索使研究人员能够将一个目标蛋白或核苷酸序列(称为查询)与一个数据库进行比较,并识别某个特定阈值以上的与目标序列相似的库序列。在线的BLAST功能只需要将序列输入,然后BLAST,最后会给...
进入该文件夹: cd ncbi-blast-2.13.0+-src 在文件夹中,您将看到一个名为c++的目录,这是编译BLAST+的起点。运行以下命令来编译和安装BLAST+: cd c++ make sudo make install 编译和安装过程可能需要一些时间。完成后,您可以通过以下命令来验证BLAST+是否正确安装: blastp-version 如果系统返回了BLAST+的版本信息...
一、BLAST+安装 1、linux 安装 (代码可左右滑动,下同) 2、windows 安装 下载地址:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.7.1+-x64-win64.tar.gz 解压: win+R 快捷键组会进入运行程序。输入cmd进入命令行模式。(下面两图) ...
NCBI本地Blast 安装方法批注本地保存成功开通会员云端永久保存去开通 IN HOUSE LOCAL BLAST SEARCH To get started you need theblastall.exeandformatdb.exe(From NCBI). The rest of the perl and batch programs you might need to change the path of the directories they are pointing to or the blast ...
谢谢!下载安装包链接:https://pan.baidu.com/s/1Fw4J9kIOCTsiYWdCC86Asw 提取码:yyds NCBI:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ Blast:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast 展开更多校园分享官 知识 校园学习 视频教程 学习 生物 教育 经验分享 基因 学习心得 qPCR 校园分享官第3期...
INHOUSELOCALBLASTSEARCHTogetstartedyouneedtheblastall,e,eandformatdb,e,e,FromNCBI,Therestoftheperlandbatchprogramsyoumig
export PATH="/public/home/wlxie/blast/bin:$PATH" 保存退出后重新source一下.bashrc文件,blast+工具就安装好了。 2 下载nr/nt数据库 我们比对一般用的是NCBI的非冗余蛋白/核酸数据库,有两种方法下载nr/nt数据库: 1.通过blast+工具自带的更新程序下载 ...
NCBI本地Blast 安装方法IN HOUSE LOCAL BLAST SEARCH To get started you need theblastall.exeandformatdb.exe(From NCBI). The rest of the perl and batch programs you might need to change the path of the directories they are pointing to or the blast option they use, could be downloaded from:...