在ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/中下载最新的BLAST可执行程序(不要下载源代码`,源码编译非常慢),选择预编译版本,如ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz。如果服务器能联网,可直接用wget下载。或者,下载后用SFTP客户端传输到服务器上。 wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/...
一:安装blast 1. 下载blast: $wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz 2. 解压: $tar zxvf ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz 3. 将blast添加进环境 $vim ~/.bashrc $export PATH=/data1/spider/ytbiosoft/ncbi-blast-2.8.1+...
1. 下载并安装BLAST+ 打开下载地址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ # 下载安装包 xjf@ubuntu:~$ wget -c ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz # 解压 xjf@ubuntu:~$ tar -zxvf ncbi-blast-2.7.1+-x...
https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2105-10-421 一、BLAST+安装 1、linux 安装 (代码可左右滑动,下同) 2、windows 安装 下载地址:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.7.1+-x64-win64.tar.gz 解压: win+R 快捷键组会进入运行程序。
blast+安装及使用 blast+是ncbi最重要的功能,用来找同源基因序列。 cd /ifs1/Software/biosoft wget -c ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz tar -zxvf ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz 将程序链接到bin目录下 for i in ncbi-blas...
1.下载安装包https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 2.双击下载的安装包,如下所示表式安装成功 3.创建数据库文件夹并添加路径到环境变量 4.使用makeblastdb自定义参考基因组文件,例如这里创建hg19.fa,out为hg19 5.使用时候注意,-db的名字为上一步-out的名字,按照如下即可。... ...
===未完待续 BLAST简介: BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)的英文缩写,意即碱基局部对准检索工具,是一种序列类似性检索工具。它采用 统计学记分系统,能将真正配对的序列同随机产生的干扰序列区别…
3.2 BLAST output formats 标准的BLAST输出格式包括默认的配对比对格式(default pairwise alignment)、搜索定位的多序列比对格式(query-anchored multiple sequence alignment formats)、简单的可解析的Hit Table格式以及按照分类学给出的报告格式等。一种叫做“按照同一性进行配对(Pairwise with identities)”的格式能更好...
NCBI blast 2.12.0Linux (0)踩踩(0) 所需:1积分 ta-lib 0.4.29 64位 2024-09-24 07:36:26 积分:1 linux下nginx的安装配置 2024-09-24 05:58:07 积分:1 HCNetSDKV6.1.9.45-build20220902-ArmLinux64 2024-09-24 04:40:16 积分:1 【swigwin-4.2.1】window下的swigwin-4.2.1安装包 ...
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ Web版程序地址: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastp&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome 下面以linux下构建本地分析为例: 1)下载安装完成后,使用BLAST+自带的update_blastdb.pl脚本下载nr和nt等库文件,直接运行...