在ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/中下载最新的BLAST可执行程序(不要下载源代码`,源码编译非常慢),选择预编译版本,如ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz。如果服务器能联网,可直接用wget下载。或者,下载后用SFTP客户端传输到服务器上。 wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/...
一:安装blast 1. 下载blast: $wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz 2. 解压: $tar zxvf ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz 3. 将blast添加进环境 $vim ~/.bashrc $export PATH=/data1/spider/ytbiosoft/ncbi-blast-2.8.1+...
1. 下载并安装BLAST+ 打开下载地址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ # 下载安装包 xjf@ubuntu:~$ wget -c ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz # 解压 xjf@ubuntu:~$ tar -zxvf ncbi-blast-2.7.1+-x...
[Linux] NCBI BLAST Mgaic Amy DIY爱好者/Need 向上的力量40 人赞同了该文章 ===未完待续 BLAST简介: BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)的英文缩写,意即碱基局部对准检索工具,是一种序列类似性检索工具。它采用统计学记分系统,能将真正配对的序列同随机产生的干扰序列区别开来;同时采用启发式算法系统,即采...
刚刚Google了一下，可能原因是，blast根本就不是真正支持多线程的，提供两个链接供参考 http://www....
之前我也是发现多线程-num_threads参数不能实现多线程，今天因为一些别的需求看了说明文档，发现加入参数-...
BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。BLAST 采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。Blast中常用的程序介绍:1、BLASTP是蛋白序列到蛋白库...
We will demonstrate how to use the Docker image to run BLAST analysis on the Google Cloud Platform (GCP) and Amazon Web Services (AWS) using a small basic example and a more advanced production-level example. Some basic knowledge of Unix/Linux commands and BLAST+ is useful in completing ...
BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。BLAST 采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。Blast中常用的程序介绍:1、BLASTP是蛋白序列到蛋白库...
Release 2.10.2 ofsra-toolsprovides access to all thepublic and controlled-access dbGaPof SRA in the AWS and GCP environments(Linux only for this release). This vast archive's original submission format and SRA-formatted data can both be accessed and computed on these clouds, eliminating the ne...