qPCR——引物设计——NCBI-CDD查看基因的保守结构域(简单实用)二哈学姐 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多 1111 0 01:47 App 最新Pfam查找基因保守结构域,一分钟学会 6412 1 06:12 App 如何设计并验证qPCR引物|超详细教程| 1636 0 02:32 App NCBI查找保守结构域 1486 0 07
NCBI-cdd保守结构域预测 attachments-2018-07-HXZXbUUl5b55498230963.jpg 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进⼊:粘贴基因的蛋⽩序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基因的GI或Accession号,也可以直接数据这些ID就可以查询,右⽅OPTIONS中选择要搜索的数据库,Expect Value等,或者...
NCBI-cdd保守结构域预测利⽤NCBI当中的CD-search⼯具预测基因的保守结构域CDD基因家族NCBI保守结构域搜索鉴定基因的保守结构域,应该⽤专门搜索基因的保守结构域⼯具CD-search,⽽不是简单的⽤blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是⾮常重要的,因为⾏驶相同相近功能的基因往往...
CDD: NCBI’s conserved domain database. Nucleic Acids Res. 43 D222–D226. 10.1093/nar/gku1221 [ Cross Ref ]Marchler-Bauer A, Derbyshire MK, Gonzales NR, Lu S, Chitsaz F, Geer LY, et al. CDD: NCBI's conserved domain database. Nucleic Acids Res. 2014....
NNCCBBII--ccdddd保保守守结结构构域域预预测测 利利⽤⽤ NNCCBBII 当当中中的的CCDD--sseeaarrcchh⼯⼯具具预预测测基基 因因的的保保 守守结结构构域域 CDD 基因家族 NCBI 保守结构域 索鉴定基因的保守结构域,应该⽤专门 索基因的保守结构域⼯具CD-search,⽽不是简单的⽤blast 索注释。快...
1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基...
Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注释: 工具提供有关查询序列中结构域的信息,包括结构域的名称、位置以及与数据库中其他蛋白质的相...
Conserved DomAIn Database(CDD):这个数据库收集了已知蛋白质序列中的保守功能域,并提供域的注释和分类信息。研究人员可以通过CDD来分析蛋白质中的功能域组合和结构特征,从而推断其功能和相似性。 Structure-Function Linkage Database(SFLD):这个数据库整合了蛋白质序列、结构和功能之间的关系,并提供了详细的注释和分类...
Gene数据库为用户提供基因序列注释和检索服务,还会链接到NCBI的Map Viewer、Evidence Viewer、ModelMaker、BLAST Link (Blink)、protein domains from the Conserved DomainDatabase(CDD)等数据库资源以及其它与基因相关的资源。Entrez Gene数据库收录了来自5300多个物种的430万...
网址: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi 输出结果: Name: 保守结构域的名称或标识符,也可以是结构域的通用名称。 Accession: 保守结构域的数据库访问号。 Description: 保守结构域的描述性信息, 提供了关于保守结构域功能、结构和可能的生物学意义的文字描述。