1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基...
qPCR——引物设计——NCBI-CDD查看基因的保守结构域(简单实用), 视频播放量 9215、弹幕量 3、点赞数 124、投硬币枚数 42、收藏人数 323、转发人数 96, 视频作者 二哈学姐, 作者简介 在职在读博士,苦逼的科研打工人!一直在路上!,相关视频:如何设计并验证qPCR引物|超详
CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注...
NCBI-cdd保守结构域预测 attachments-2018-07-HXZXbUUl5b55498230963.jpg 2.预测单条序列的保守结构域，点击CD-search进⼊：粘贴基因的蛋⽩序列，或者是核酸序列都可以，注意为fasta序列，如果你知道基因的GI或Accession号，也可以直接数据这些ID就可以查询，右⽅OPTIONS中选择要搜索的数据库，Expect Value等，或者...
Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注释: 工具提供有关查询序列中结构域的信息,包括结构域的名称、位置以及与数据库中其他蛋白质的相...
使用CD-Search 有助于研究者理解蛋白质的功能,特别是那些在不同生物中高度保守的结构域,这些结构域通常对蛋白质的基本功能起到关键作用。 干货来了,具体操作步骤如下: 网址: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi 输出结果: Name: 保守结构域的名称或标识符,也可以是结构域的通用名称。
CD-Search与Conserved Domain Database(CDD)集成，为用户提供了一站式解决方案，能够快速、准确地在蛋白质序列中识别保守结构域。该工具通过分析提交的序列数据，自动识别其中的保守结构域，并以易于理解和解释的形式呈现结果。CD-Search的功能主要包括：数据库搜索：使用CDD中的结构域数据库对输入的蛋白质...
NCBI-cdd保守结构域预测利⽤NCBI当中的CD-search⼯具预测基因的保守结构域CDD基因家族NCBI保守结构域搜索鉴定基因的保守结构域,应该⽤专门搜索基因的保守结构域⼯具CD-search,⽽不是简单的⽤blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是⾮常重要的,因为⾏驶相同相近功能的基因往往...
CD-Search的核心功能包括利用Conserved Domain Database (CDD) 进行结构域识别，提供详尽的注释，支持多模式搜索，以及直观的图形和表格结果展示。它特别适用于理解高度保守的结构域，这些结构域对蛋白质功能的维持起到关键作用。具体操作时，无论是单个序列的搜索还是批量处理，CD-Search都能输出丰富的信息，...
NNCCBBII--ccdddd保保守守结结构构域域预预测测 利利⽤⽤ NNCCBBII 当当中中的的CCDD--sseeaarrcchh⼯⼯具具预预测测基基 因因的的保保 守守结结构构域域 CDD 基因家族 NCBI 保守结构域 索鉴定基因的保守结构域,应该⽤专门 索基因的保守结构域⼯具CD-search,⽽不是简单的⽤blast 索注释。