Conserved Domain Architecture Retrieval Tool (CDART) 显示构成给定蛋白质序列的功能域。它列出了具有相似结构域结构的蛋白质,并且可以检索含有特定结构域组合的蛋白质。 Conserved Domain Search Service (CD Search) 鉴定蛋白质序列中存在的保守结构域。 E-Utilities 在常规Web查询界面之外提供对NCBI Entrez系统内数据...
简介 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是由NCBI(National Center for Biotechnology Information)开发的基于局部比对算法的一组搜索工具。BLAST包含有NCBI的很多数据库。 BLAST主要包括BLASTn,BLASTp,BLASTx,tBLASTn 和tBLASTx。 官网:BLAST: Basic Local Al...
Conserved Domain Architecture Retrieval Tool (CDART) 显示构成给定蛋白质序列的功能域。 它列出了具有相似结构域结构的蛋白质,并且可以检索含有特定结构域组合的蛋白质。 Conserved Domain Search Service (CD Search) 鉴定蛋白质序列中存在的保守结构域。 E-Utilities 在常规Web查询界面之外提供对NCBI Entrez系统内数据...
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)找到生物序列之间的局部相似性区域，该程序将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较，并计算匹配的统计显着性。 BLAST可用于推断序列之间的功能和进化关系，以及帮助鉴定基因家族的成员。Batch Entrez 允许你提交Nucleotide、Protein或其他Entrez数据库中的GI、登录号或其他唯一标...
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) Batch Entrez CDTree COBALT Cn3D Coffee Break Conserved Domain Architecture Retrieval Tool (CDART) Conserved Domain Search Service (CD Search) E-Utilities Ebot Gene Expression Omnibus (GEO) BLAST Genetic Codes Genome BLAST Genome Data Viewer (GDV) Genome De...
下载格式转换工具:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/converters/by_program/gene2xml/linux64.gene2xml.gz 在终端依次运行下列命令 mkdir ncbi cd ncbi mkdir ags mkdir tool cd tool wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/converters/by_program/gene2xml/linux64.gene2xml...
BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一种常用的序列比对工具,可以比对两个或多个序列之间的相似性。BLAST可以对蛋白质序列进行比对,找出相似性较高的区域,并给出相似性分数。 CD-Search CD-Search是一种用于蛋白质结构与功能域的搜索工具。它可以通过比对蛋白质序列与已知结构域数据库中的序列,找出与之相似...
1.打开BLAST页而,打开后如图所示:BLASTBasic local Alignment Search ToolHomeUcent Resulu Saved Stratogies Help NCeiBLASISLA ST finds regions of s-imilority between biological sequences, mare.I zm mwe about how to um th. mew BLAST designBLAST Assembled Geno 40、mesChoose 4 species genome(o ...
NCBI无法查询蛋白质等电点，可以到swissprot查询。这个NCBI没有相关的功能，这个是以核苷酸序列为主。因为等电点特性是蛋白质水平的分子特性，可以到swissprot进行查询，查询蛋白质等电点需要到专业的平台进行查询。另外NCBI开发有Genbank等公共数据库，提供Pubmed、BLAST、Entrez、OMIM、Taxonomy等工具，可对...
‧VAST-Vector Alignment Search Tool一鉴定相似蛋白质3-D结构\ 工具,将MMDB相似结构计算后整理归类,并在MMDB网页建立归类 连结。VAST可找出从序列比对无法鉴定的同源蛋白质(网址: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/VAST/vast.shtml)。 ‧Conserved Domain Database(CDD)一蛋白质保留区序列数据库, 提供...