Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)找到生物序列之间的局部相似性区域,该程序将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较,并计算匹配的统计显着性。 BLAST可用于推断序列之间的功能和进化关系,以及帮助鉴定基因家族的成员。Batch Entrez 允许你提交Nucleotide、Protein或其他Entrez数据库中的GI、登录号或其他唯一标...
NCBI无法查询蛋白质等电点,可以到swissprot查询。这个NCBI没有相关的功能,这个是以核苷酸序列为主。因为等电点特性是蛋白质水平的分子特性,可以到swissprot进行查询,查询蛋白质等电点需要到专业的平台进行查询。另外NCBI开发有Genbank等公共数据库,提供Pubmed、BLAST、Entrez、OMIM、Taxonomy等工具,可对国...
Conserved Domain Architecture Retrieval Tool (CDART) 显示构成给定蛋白质序列的功能域。它列出了具有相似结构域结构的蛋白质,并且可以检索含有特定结构域组合的蛋白质。 Conserved Domain Search Service (CD Search) 鉴定蛋白质序列中存在的保守结构域。 E-Utilities 在常规Web查询界面之外提供对NCBI Entrez系统内数据...
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) Batch Entrez CDTree COBALT Cn3D Coffee Break Conserved Domain Architecture Retrieval Tool (CDART) Conserved Domain Search Service (CD Search) E-Utilities Ebot Gene Expression Omnibus (GEO) BLAST Genetic Codes Genome BLAST Genome Data Viewer (GDV) Genome De...
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) 找到生物序列之间的局部相似性区域,该程序将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较,并计算匹配的统计显着性。 BLAST可用于推断序列之间的功能和进化关系,以及帮助鉴定基因家族的成员。 Batch Entrez 允许你提交Nucleotide、Protein或其他Entrez数据库中的GI、登录号或其他唯一...
"I see in 3D" (iCn3D) Structure Viewer is not only a web-based 3D viewer, but also a structure analysis tool interactively or in the batch mode using NodeJS scripts based on the npm package icn3d. iCn3D synchronizes the display of 3D structure, 2D interaction, and 1D sequences and ...
网址:github.com/kblin/ncbi-g 1.下载安装 git clone https://github.com/kblin/ncbi-genome-download.git cd ncbi-…阅读全文 赞同5 5 条评论 分享收藏 请问怎样用BLAST验证miRNA的引物? 爱科普的小码哥 专注胰腺健康 使用BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)验证miRNA引物通常是...
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cdd_help.shtml#BatchRPSBInput Batch CD-Search Help documentation https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/docs/cdd_news.html CDD News page (for most recent domain database versions) https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi BLAST Homepage https...
c:> cd Blast c:\>Blast\perl BlastList.pl The file BlastList.pl automatically creates a batch file “DosBlast.bat” depending on the list of the sequence to be blasted. 5) Run DosBlast.bat c:\>Blast\ DosBlast.bat DosBlast.bat is the actual file that does the blast search. II. St...
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) 找到生物序列之间的局部相似性区域,该程序将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较,并计算匹配的统计显着性。 BLAST可用于推断序列之间的功能和进化关系,以及帮助鉴定基因家族的成员。 Batch Entrez 允许你提交Nucleotide、Protein或其他Entrez数据库中的GI、登录号或其他唯一...