1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基...
Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注释: 工具提供有关查询序列中结构域的信息,包括结构域的名称、位置以及与数据库中其他蛋白质的相...
1. Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 2. 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 3. 结构域注释: 工具提供有关查询序列中结构域的信息,包括结构域的名称、位置以及与数据库中...
CD-Search与Conserved Domain Database(CDD)集成，为用户提供了一站式解决方案，能够快速、准确地在蛋白质序列中识别保守结构域。该工具通过分析提交的序列数据，自动识别其中的保守结构域，并以易于理解和解释的形式呈现结果。CD-Search的功能主要包括：数据库搜索：使用CDD中的结构域数据库对输入的蛋白质序...
NCBI-cdd保守结构域预测 attachments-2018-07-HXZXbUUl5b55498230963.jpg 2.预测单条序列的保守结构域，点击CD-search进⼊：粘贴基因的蛋⽩序列，或者是核酸序列都可以，注意为fasta序列，如果你知道基因的GI或Accession号，也可以直接数据这些ID就可以查询，右⽅OPTIONS中选择要搜索的数据库，Expect Value等，或者...
qPCR——引物设计——NCBI-CDD查看基因的保守结构域(简单实用), 视频播放量 8662、弹幕量 3、点赞数 111、投硬币枚数 38、收藏人数 298、转发人数 86, 视频作者 二哈学姐, 作者简介 在职在读博士,苦逼的科研打工人!一直在路上!,相关视频:蛋白结构域预测,NCBI CD-Sea
NCBI-cdd保守结构域预测利⽤NCBI当中的CD-search⼯具预测基因的保守结构域CDD基因家族NCBI保守结构域搜索鉴定基因的保守结构域,应该⽤专门搜索基因的保守结构域⼯具CD-search,⽽不是简单的⽤blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是⾮常重要的,因为⾏驶相同相近功能的基因往往...
CD-Search的核心功能包括利用Conserved Domain Database (CDD) 进行结构域识别，提供详尽的注释，支持多模式搜索，以及直观的图形和表格结果展示。它特别适用于理解高度保守的结构域，这些结构域对蛋白质功能的维持起到关键作用。具体操作时，无论是单个序列的搜索还是批量处理，CD-Search都能输出丰富的信息，...
NNCCBBII--ccdddd保保守守结结构构域域预预测测 利利⽤⽤ NNCCBBII 当当中中的的CCDD--sseeaarrcchh⼯⼯具具预预测测基基 因因的的保保 守守结结构构域域 CDD 基因家族 NCBI 保守结构域 索鉴定基因的保守结构域,应该⽤专门 索基因的保守结构域⼯具CD-search,⽽不是简单的⽤blast 索注释。
CDD是一种蛋白质注释资源,由一系列经过充分注释的古代结构域和全长蛋白质序列比对模型组成。 Database of Genomic Structural Variation (dbVar) dbVar数据库储存了大规模基因组变异相关的信息,包括大插入,缺失,易位和倒位。 除了分类突变之外,dbVar还存储已定义突变与表型信息的关联。