Conserved DomAIn Database(CDD):这个数据库收集了已知蛋白质序列中的保守功能域,并提供域的注释和分类信息。研究人员可以通过CDD来分析蛋白质中的功能域组合和结构特征,从而推断其功能和相似性。 Structure-Function Linkage Database(SFLD):这个数据库整合了蛋白质序列、结构和功能之间的关系,并提供了详细的注释和分类...
Gene数据库为用户提供基因序列注释和检索服务,还会链接到NCBI的Map Viewer、Evidence Viewer、ModelMaker、BLAST Link (Blink)、protein domains from the Conserved DomainDatabase(CDD)等数据库资源以及其它与基因相关的资源。Entrez Gene数据库收录了来自5300多个物种的430万...
5.1数据库 5.1.1 Entrez Gene Entrez Gene数据库为用户提供基因序列注释和检索服务,还会链接到NCBI的Map Viewer、Evidence Viewer、Model Maker、BLAST Link (Blink)、protein domains from the Conserved Domain Database(CDD)等数据库资源以及其它与基因相关的资源。Entrez Gene数据库收录了来自5300多个物种的430万条基...
Protein Cluster数据库提供存在一定联系的蛋白质集合信息，并与蛋白质注释、结构、结构域（如NCBI Conserved DomainDatabase，CDD）、家族相关数据库之间交互访问。Structure数据库是由蛋白质三维结构数据库PDB（the Protein Data Bank））衍生而来的大分子模建数据库，提供蛋白质三维结构信息及相关的可视化和结构比对工具。...
Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。 结构域注释: 工具提供有关查询序列中结构域的信息,包括结构域的名称、位置以及与数据库中其他蛋白质的相...
📚 NCBI包括的数据库有: BioProject:描述基因组学、功能基因组学和遗传学研究项目,提供项目范围、材料和目标等信息。 Conserved Domain Database (CDD):包含经过充分注释的古代结构域和全长蛋白质序列比对模型。 Gene:专注于完全测序的基因组,提供基因特异性数据,如命名法、染色体定位、基因产物及其属性等。🔬 ...
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在收集和存储生物医学信息方面,NCBI数据库提供了各种生物医学的数据,如核酸序列、蛋白质序列、文献信息、遗传变异信息等。 在提供各种生物医学信息的查询和分析工具方面,NCBI数据库提供了各种查询工具,如Entrez、Pubmed等;也提供了各种分析工具,如CDD、Conserved Domain Database等。
允许你提交Nucleotide、Protein或其他Entrez数据库中的GI、登录号或其他唯一标识符的文件，从许多Entrez数据库中检索记录。CDTree 一个用于分类蛋白质序列和调查其进化关系的应用程序。 CDTree可以导入，分析和更新现有的保守域（CDD）记录和层次结构，还允许用户创建自己的记录和层次结构。 CDTree与Entrez CDD和Cn3D紧密...