NCBI-cdd保守结构域预测利⽤NCBI当中的CD-search⼯具预测基因的保守结构域CDD基因家族NCBI保守结构域搜索鉴定基因的保守结构域,应该⽤专门搜索基因的保守结构域⼯具CD-search,⽽不是简单的⽤blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是⾮常重要的,因为⾏驶相
NCBI-cdd保守结构域预测 attachments-2018-07-HXZXbUUl5b55498230963.jpg 2.预测单条序列的保守结构域，点击CD-search进⼊：粘贴基因的蛋⽩序列，或者是核酸序列都可以，注意为fasta序列，如果你知道基因的GI或Accession号，也可以直接数据这些ID就可以查询，右⽅OPTIONS中选择要搜索的数据库，Expect Value等，或者...
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1.CDD入口:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/,该工具为NCBI提供的,NCBI主页选项口选择进入Conserved Domain然后点击Search。 然后选择CD-search(单个基因),或者Batch CD-Search(多个基因)。 2.预测单条序列的保守结构域,点击CD-search进入: 粘贴基因的蛋白序列,或者是核酸序列都可以,注意为fasta序列,如果你知道基...
qPCR——引物设计——NCBI-CDD查看基因的保守结构域(简单实用), 视频播放量 9824、弹幕量 3、点赞数 127、投硬币枚数 42、收藏人数 337、转发人数 97, 视频作者 二哈学姐, 作者简介 在职在读博士,苦逼的科研打工人!一直在路上!,相关视频:最新Pfam查找基因保守结构域
CD(Conserved Domain)是NCBI提供的一种用于查找保守结构域的工具。 CD-Search 的主要功能包括: Conserved Domain Database (CDD): CD-Search使用NCBI的Conserved Domain Database,这是一个包含已知结构域的数据库。 结构域识别: 用户可以提交蛋白质序列,CD-Search会对该序列进行分析,识别其中的保守结构域。
NCBI的MMDB数据库收录了Protein Data Bank数据库中经试验验证过的数据信息,包括蛋白质结构域注释信息、与相关文献的链接信息、蛋白质和核酸序列信息、PDB异基因(PDB heterogens)信息、CDD中的保守结构域信息和经VAST算法计算出的结构邻域(structural neighbors)信息。用户可...
分析和更新现有的保守域（CDD）记录和层次结构，还允许用户创建自己的记录和层次结构。 CDTree与Entrez CDD和Cn3D紧密集成，允许用户创建和更新蛋白质域对齐。COBALT COBALT是一种蛋白质多序列比对工具，使用RPS-BLAST，BLASTP和PHI-BLAST找到从保守结构域数据库，蛋白质基序数据库和序列相似性衍生的成对约束的集合。
CDTree可以导入,分析和更新现有的保守域(CDD)记录和层次结构,还允许用户创建自己的记录和层次结构。 CDTree与Entrez CDD和Cn3D紧密集成,允许用户创建和更新蛋白质域对齐。 COBALT COBALT是一种蛋白质多序列比对工具,使用RPS-BLAST,BLASTP和PHI-BLAST找到从保守结构域数据库,蛋白质基序数据库和序列相似性衍生的成对...
NCBI的MMDB数据库收录了Protein Data Bank数据库中经试验验证过的数据信息,包括蛋白质结构域注释信息、与相关文献的链接信息、蛋白质和核酸序列信息、PDB异基因(PDB heterogens)信息、CDD中的保守结构域信息和经VAST算法计算出的结构邻域(structural neighbors)信息。用户可以通过在MMDB数据库中进行文本搜索得到相关的简...