我的python安装在D盘,所以python.exe的路径就好设置了: 构建配体-受体-TF-mRNA多层网络: #计算配体-受体-TF-mRNA多层网络netList<- RunMLnet(sample@assays$RNA,"cellType.txt", RecClu, LigClu,pval, logfc)#可视化DrawMLnet(netList,LigClu,RecClu,workdir,PyHome,plotMLnet = T) 当然以上是单独两个细胞...
miRNA–mRNA–TFRegulatory networksBioinformaticsPeriodontitis is a complex infectious disease with various causes and contributing factors. The aim of this study was to identify key genes, microRNAs (miRNAs) and transcription factors (TFs) and construct a miRNA–mRNA–TF regulatory networks to ...
转铁蛋白(Tf)能与细胞膜上的转铁蛋白受体(TfR)结合,介导含铁的蛋白质从细胞外进入细胞内。细胞中转铁蛋白受体mRNA(TfR-mRNA)的稳定性受Fe3+含量的调节(
绿色圆形表示TF,菱形表示miRNA 7. 合并TF-miRNA调控关系及miRNA-mRNA作用关系来构建miRNA调控网络。 图7. TF-miRNA-mRNA调控网络。菱形表示miRNA,绿色圆形表示TF,蓝色圆形表示mRNA,箭头表示调控关系,线条表示蛋白质互作。 参考文献 1. Friedman RC, Farh KK, Burge CB, et al. Most mammalian mRNAs are conserved...
TF是转录因子，调控转录产物的，可以是mRNA，也是非编码RNA（例如miRNA），也可是其他。miRNA也可以作用于mRNA，影响mRNA的表达。反正，应该是一个调控的网络。
构建TF-mRNA-miRNA调控网络(利用TRRUST和Mirwalk网站)并用Cytoscape作图 亚卡达力biu 8440 1 08:20 如何使用Cytoscape做一个精美的ppi网络图(版本3.7.1) 黑眉锦蛇呀 1.6万 2 04:55 Cytoscape绘制成分靶点网络输入文件准备#精简教程 小L-Daily 9663 6 11:54 networkanalyst网站结合cytoscape软件构建gene...
METTL3通过m6A-IGF2BP2依赖机制稳定BATF mRNA稳定性,从而促进BATF表达 为了确定介导METTL3-m6A相关效应的关键调节因子,作者在LPS刺激的小胶质细胞中进行了MeRIP-seq和RNA-seq分析,这些细胞有或没有METTL3敲除。在MeRIP-seq分析中,m6A修...
转铁蛋白(Tf)能与细胞膜上的转铁蛋白受体(TfR)结合,介导含铁的蛋白质从细胞外进入细胞内。细胞中转铁蛋白受体mRNA的稳定性受Fe3+含量的调节(如图),铁反应元件是
23.(基因表达及实验设计)转铁蛋白(Tf)能与细胞膜上的转铁蛋白受体(TfR)结合,介导含铁的蛋白质从细胞外进入细胞内。 细胞中转铁蛋白受体mRNA的稳定性受Fe3+含量的调节(如下图)铁反应元件是转铁蛋白受体mRNA 上一段富含碱基 A、U 的序列,当细胞中Fe3+浓度高时,铁调节蛋白结合Fe3而不能与铁反应元件结合,导...
TFAP2a mRNA原位杂交试剂盒原位杂交是在一定生物结构基础之上的核酸杂交。这种结构基础可以是一条染色体;一个细菌;更大结构基础是细胞和组织。基本原理是两条核苷酸单链片段,在适宜的条件下,通过氢键结合,形成DNA-DNA、DNA-RNA或RNA-RNA 双键分子,应用带有标记的(有放射性同位素,如3H、35S、32P、荧光素生物素等非...