TF是转录因子，调控转录产物的，可以是mRNA，也是非编码RNA（例如miRNA），也可是其他。miRNA也可以作用于mRNA，影响mRNA的表达。反正，应该是一个调控的网络。
miRNA–mRNA–TFRegulatory networksBioinformaticsPeriodontitis is a complex infectious disease with various causes and contributing factors. The aim of this study was to identify key genes, microRNAs (miRNAs) and transcription factors (TFs) and construct a miRNA–mRNA–TF regulatory networks to ...
我的python安装在D盘,所以python.exe的路径就好设置了: 构建配体-受体-TF-mRNA多层网络: #计算配体-受体-TF-mRNA多层网络netList<- RunMLnet(sample@assays$RNA,"cellType.txt", RecClu, LigClu,pval, logfc)#可视化DrawMLnet(netList,LigClu,RecClu,workdir,PyHome,plotMLnet = T) 当然以上是单独两个细胞...
绿色圆形表示TF,菱形表示miRNA 7. 合并TF-miRNA调控关系及miRNA-mRNA作用关系来构建miRNA调控网络。 图7. TF-miRNA-mRNA调控网络。菱形表示miRNA,绿色圆形表示TF,蓝色圆形表示mRNA,箭头表示调控关系,线条表示蛋白质互作。 参考文献 1. Friedman RC, Farh KK, Burge CB, et al. Most mammalian mRNAs are conserved...
scMLnet 包:使用单细胞测序数据推断细胞通讯中的“配体-受体-TF-mRNA”调控网络(... 生信碱移 scMLnet 使用笔记 本文将介绍如何使用 scMLnet 从单细胞 RNA 测序数据推断细胞通讯中的... 春秋至阅读2,556评论0赞16 10X单细胞(10X空间转录组)之配受体联合TF因子的通讯分析(cellcall) ...
Combination of differentially expressed mRNAs and miRNAs with miRNA–mRNA interactions based on crosslinking and immunoprecipitation followed by high-throughput sequencing (CLIP-Seq) data from StarBas, we constructed miRNA–mRNA regulatory network. Then we constructed two regulatory networks including TF–...
networkanalyst使用|预测TF-gene,TF-miRNA,disease-chemical等相互作用网络并用Cytoscape作图 亚卡达力biu 5079 0 12:01 构建TF-mRNA-miRNA调控网络(利用TRRUST和Mirwalk网站)并用Cytoscape作图 亚卡达力biu 8793 1 14:01 10.疾病-通路-靶点-成分-药物网络构建(Cytoscape) 药学生阿程 10.7万 135 1:46...
转铁蛋白(Tf)能与细胞膜上的转铁蛋白受体(TfR)结合,介导含铁的蛋白质从细胞外进入细胞内。细胞中转铁蛋白受体mRNA(TfR-mRNA)的稳定性受Fe3+含量的调节(
产品名称:TFF1 mRNA原位杂交试剂盒 规格:100T/盒 特异性:人、小鼠 标记方式: 3’—尾段标记 保存条件: 4°C保存一年 试剂盒内容: 1.TFF1寡核苷酸探针杂交液 2ml; 2.预杂交液 2ml; 3.胃蛋白酶(×10;Pepsin) 2ml; 4.封闭液 5ml; 5.生物素化鼠抗 5ml; 6.SABC-POD 5ml;TFF1 mRNA原位杂交试剂盒...
networkanalyst使用|预测TF-gene,TF-miRNA,disease-chemical等相互作用网络并用Cytoscape作图 亚卡达力biu 5093 0 06:39 构建ceRNA网络方法。ceRNA图。生物信息 mRNA-lncRNA-miRNA图 生信分析666 1.9万 10 11:54 networkanalyst网站结合cytoscape软件构建gene-mirna-tf三联互作网络图 熬夜干科研 731 1 14:...