高通量测序目前主要以m6A-seq/MeRIP-seq为主,它是目前研究m6A修饰使用最广泛的技术之一。 MeRIP-seq将甲基化DNA 免疫共沉淀(methylated DNA immunoprecipitation, MeDIP)技术、RNA 结合蛋白免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)技术和RNA 测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术组合起来,高精度地检测全基因组(或全转录组...
m6A修饰是动态可逆的,包括甲基化转移酶(Writers)如METTL3介导的m6A的添加、去甲基化酶(Erasers)如FTO介导的m6A的去除以及甲基化阅读蛋白(Readers)如YTHDF2介导的m6A甲基化的识别,对m6A修饰调控机制的的研究有助于我们深入了解RNA甲基化修饰的生物学功能和作用机制。 MeRIP-seq(m6A-seq)是在全转录组水平上鉴定m6A修...
将含protein A和protein G的磁珠用IP buffer(150 mM NaCl, 10 mM Tris-HCl pH 7.5)洗涤,然后与5 ugm6A抗体(Millipore) 4℃孵育2h;用 IP buffer洗涤两次,再用 IP buffer将磁珠重悬,加入片段化的RNA,4℃下翻转4h;用IP buffer在4℃下洗涤磁珠3次,再用m6A竞争性洗脱液,在4℃下孵育1h。将含有洗脱m6A RNA...
四、总结:甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)研究思路 MeRIP通过m6A特异性抗体富集和测序,用于研究RNA的腺苷甲基化修饰。易基因自主研发微量RNA甲基化检测技术,样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需5μg总RNA。 m6A研究思路 整体把握m6A甲基化图谱特征:m6A peak数量变化、m6A修饰基因数量变化、单个基因m6A pe...
m6A甲基化是转录后调控中重要的表观遗传修饰方式,它普遍存在于病毒和真核生物中。MeRIP-seq(高通量测序法)作为m6A修饰的检测方法,其具有针对全基因组范围内检测m6A的存在;能够明确每个基因的修饰水平,进行组与组之间比较等优势。接下来就让小编带大家详细了解m6A和MeRIP-seq。
m6A是RNA上最丰富的一种修饰,平均每条转录本有1~3个m6A修饰。易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、...
2、选择需要委托的服务项目,如MeRIP-seq,则点击进入高通量测序模块。 3、填写需求信息并提交,选择需要委托的测序服务类型MeRIP-seq,并填写样本等信息,直接提交成功。 关于m6A研究背景 请登陆锐博生物官网www.ribobio.com,花3分钟注册一个账户,即可在线委托MeRIP-seq整体服务啦~~~ ...
发现非典型修饰位点:MeRIP-seq帮助研究者发现METTL14R298P突变优先修饰含有GGAU motif的非典型位点,这一发现是本研究的核心突破。 关联基因表达与m6A修饰:结合RNA-seq数据,MeRIP-seq结果帮助研究者分析m6A修饰变化与基因表达之间的关联,揭示了突变对WNT信号通路和细胞运动相关基因表达的影响。
RNA甲基化是近年来研究基因表达调控转录后变化的重要研究领域,包括N6-甲基腺苷(m6A)在内的各种类型RNA甲基化参与人类疾病发展。MeRIP-seq作为一种新兴的在转录组范围内定量检测m6A水平的测序技术,拓展了RNA表观遗传学研究的基础和临床应用,且呈上升趋势。RNA甲基化数据分析的基本问题之一是通过对比病例和对照来鉴定差异...
MeRIP-Seq (m6A-seq, m1A-seq, m5C-seq, m7G-seq) m6A研究背景 m1A研究背景 m5C研究背景 m7G研究背景 服务特点 实验流程 结果展示 m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)是真核生物mRNA内部序列中最常见的一种甲基化修饰,同时可以功能性的调节真核生物的转录组从而影响mRNA的剪接、出核、定位、翻译和稳定。m6...