高通量测序目前主要以m6A-seq/MeRIP-seq为主,它是目前研究m6A修饰使用最广泛的技术之一。 MeRIP-seq将甲基化DNA 免疫共沉淀(methylated DNA immunoprecipitation, MeDIP)技术、RNA 结合蛋白免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)技术和RNA 测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术组合起来,高精度地检测全基因组(或全转录组...
易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应答、癌症发生与发展、药物应答等研究领域;可应用...
F. 在SH3BP4基因位点上,IGV可视化显示RNA-seq(灰色)数据和MeRIP-seq(红色和蓝色)数据。 (7)m6A修饰调控WFS1在NX和LW猪肌肉中的差异表达 图7:m6A修饰调控NX和LW猪肌肉中WFS1的差异表达。 A. 基因组浏览器轨迹显示WFS1基因位点的RNA-seq(灰色)和MeRIP-seq(蓝色和绿色)数据。 B. MeRIP-qPCR验证WFS1的m6A...
m6A修饰是动态可逆的,包括甲基化转移酶(Writers)如METTL3介导的m6A的添加、去甲基化酶(Erasers)如FTO介导的m6A的去除以及甲基化阅读蛋白(Readers)如YTHDF2介导的m6A甲基化的识别,对m6A修饰调控机制的的研究有助于我们深入了解RNA甲基化修饰的生物学功能和作用机制。 MeRIP-seq(m6A-seq)是在全转录组水平上鉴定m6A修...
m6A甲基化是转录后调控中重要的表观遗传修饰方式，它普遍存在于病毒和真核生物中。MeRIP-seq（高通量测序法）作为m6A修饰的检测方法，其具有针对全基因组范围内检测m6A的存在；能够明确每个基因的修饰水平，进行组与组之间比较等优势。接下来就让小编带大家详细了解m6A和MeRIP-seq。 1.在介绍m6A之前，首先认识一下什么...
本研究鉴定了大约克猪(Large White, LW)和宁乡猪(Ningxiang, NX)不同品种新生仔猪肌肉发育过程中的差异表达基因,并通过MeRIP-seq绘制了m6A甲基化模式。研究结果表明,m6A修饰在肌肉发育的新生仔猪阶段调控肌肉细胞发育、肌原纤维、细胞周期和磷酸酶调节活性。且LW和NX猪中差异表达基因主要富集在参与蛋白质合成通路中。对...
merip-seq技术通过特异性的抗m6A抗体结合m6A修饰的RNA,然后进行测序分析,从而实现对m6A修饰的识别和定位。 1. m6A修饰的原理 m6A修饰是一种在RNA分子中常见的化学修饰形式,它是通过甲基转移酶复合物在RNA分子上的特定位置N6位甲基化而成。m6A修饰在调控RNA的稳定性、转录和翻译过程中起着重要作用,对于细胞的功能和...
总的来说,MeRIP-seq分析分别在shNC和shMETTL14细胞中鉴定出5461个和2861个peaks峰。此外,m6A信号在3′ UTR中大量富集。为了评估基因表达的改变是否是由m6A修饰引起的,研究人员将MeRIP-seq中282个减少的m6A峰和RNA-seq中377个改变的基因重叠,发现11个基因都被检测到。其中内源...
本研究利用MeRIP-seq和RNA-seq研究对照组和野百合碱(monocrotaline)诱导的PAH大鼠肺动脉组织中m6A和RNA表达差异。使用GO和KEGG进行功能富集分析,研究了差异表达功能。为了筛选候选m6A相关基因,使用STRING和Metascape数据库构建了蛋白质-蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络,并通过对候选相关基因表达进行实时PCR验...
2、选择需要委托的服务项目,如MeRIP-seq,则点击进入高通量测序模块。 3、填写需求信息并提交,选择需要委托的测序服务类型MeRIP-seq,并填写样本等信息,直接提交成功。 关于m6A研究背景 请登陆锐博生物官网www.ribobio.com,花3分钟注册一个账户,即可在线委托MeRIP-seq整体服务啦~~~ ...