MeRIP-qPCR就是MeRIP实验后进行一个qPCR。在RNA量充足的情况下,可以直接使用MeRIP后的产物分别进行逆转录和qPCR,其流程与普通qPCR相同。 3)MeRIP-qPCR为什么没有内参基因? MeRIP-qPCR不需要使用内参来进行样本间的对比,此实验主要是通过计算发生修饰的转录本(IP)占该基因总转录本(Input)的比例,来体现该位点的修饰水平。
1)参与该途径的细胞mRNA差异甲基化可以控制EBV再激活引起的IFN信号反应。 ebv潜伏期和再激活期间,对EBV阳性LCL和Akata细胞分离的RNA进行了MeRIP-seq分析,发现了从数百到1600多个不同数量的甲基化峰(图1B)。进一步分析了潜伏和裂解复制之间基因的差异甲基化,发现在LCL和Akata中,与潜伏(3个mRNA)相比,裂解再激活过程...
大样本量m6A-QTL性状关联分析,传统MeRIP单个样品价格高,通常难以承担。易基因开发建立MeRIP-seq2技术,显著提成IP平行性,实现不同样本间相对定量,降低检测成本。 易基因提供适用于不同科研需求的MeRIP技术: m6A甲基化-常量mRNA 甲基化测序(MeRIP-seq) m6A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化测序(lnc-MeRIP-seq) m6A甲基...
2、选择需要委托的服务项目,如MeRIP-seq,则点击进入高通量测序模块。 3、填写需求信息并提交,选择需要委托的测序服务类型MeRIP-seq,并填写样本等信息,直接提交成功。 关于m6A研究背景 请登陆锐博生物官网www.ribobio.com,花3分钟注册一个账户,即可在线委托MeRIP-seq整体服务啦~~~ ...
研究方法:m6A MeRIP-seq、 RNA-seq、RIP-qPCR、WB、dot blot 研究摘要 食管鳞状细胞癌(ESCC)是一种具有显著代谢重编程的致命恶性肿瘤,然而驱动ESCC进展的关键代谢特征仍然难以捉摸。在这里,作者发现甲硫氨酸周期在ESCC中表现出强大的激活,并且与患者生存率呈负相关。ESCC细胞容易利用外源甲硫氨酸生成S -腺苷甲硫氨酸...
图1:MeRIP-seq实验和DMR检测示意图 MeRIP-seq从RNA样本生成配对的IP数据和input对照数据。将测序reads比对至参考基因组,然后通过最近开发的统计方法鉴定差异甲基化区域(DMR)。其核心统计模型和特征列于饼图内圆,下游对DMR基因进行peak注释、biomarker发现、通路(pathway)鉴定和基因本体(GO)分析。
RNA甲基化修饰是一种重要的RNA后转录修饰，它在许多生物学过程中发挥着重要的调节作用。m6A MeRIP 试剂盒使用单一抗体捕获m6A甲基化修饰的RNA分子，具有更高的选择性和灵敏度。与传统的MeRIP技术相比，我们的试剂盒可以检测到低至10ng的RNA样品，且操作简便，操作时间更短。本试剂盒具有以下特点：1.高灵敏度：采用高...
MeRIP-seq分析显示,GGAC是检测到的peaks峰中最常见的m6A motif。总的来说,MeRIP-seq分析分别在shNC和shMETTL14细胞中鉴定出5461个和2861个peaks峰。此外,m6A信号在3′ UTR中大量富集。为了评估基因表达的改变是否是由m6A修饰引起的,研究人员将MeRIP-seq中282个减少的m6A峰和RNA-seq中377个改变的基因重叠,发现11个...
易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应答、癌症发生与发展、药物应答等研究领域;可...
m6A甲基化是转录后调控中重要的表观遗传修饰方式，它普遍存在于病毒和真核生物中。MeRIP-seq（高通量测序法）作为m6A修饰的检测方法，其具有针对全基因组范围内检测m6A的存在；能够明确每个基因的修饰水平，进行组与组之间比较等优势。接下来就让小编带大家详细了解m6A和MeRIP-seq。 1.在介绍m6A之前，首先认识一下什么...