m6A修饰广泛存在于各类生物中,包括病毒、酵母、植物和人类等。该修饰对细胞行使各种功能起着重要作用,如结合其他reader蛋白,促进miRNA成熟、介导mRNA前体的可变剪接、介导mRNA降解、驱动翻译,还有诱导出核、X染色体失活等(Qin et al 2020)(图4)。 图4 m6A修饰的功能(Qin et al 2020) 04 m6A检测方法-MeRIP-seq ...
reader(m6A 结合蛋白) 化学修饰是一种高度特异性和高效的调节生物大分子功能的方法。所有生物大分子(蛋白质、RNA、DNA、糖类和脂类)都在合成后会进行共价修饰。其中,RNA修饰是指在RNA分子合成后,通过酶催化作用对其碱基、核糖或磷酸骨架进行化学修饰的过程。这些修饰可以影响RNA的结构、稳定性、功能和相互作用,从而调控...
作为一种新的调控基因表达的方式,以m6A为代表的RNA修饰近年来受到广泛的关注和研究。m6A对于mRNA转录,剪切以及翻译等mRNA代谢的调控依赖于其识别蛋白,也就是m6A reader。在哺乳动物细胞内,目前发现有5种比较重要的m6A readers,包括YTHD...
m6a reader的分类m6A reader主要分为以下几类: * YTHDC1/2、YTHDF1/2/3、HNRNP、eIF3、IGF2BP1/2/3等。 这些m6A reader参与了m6A甲基化修饰过程,是m6A甲基化真面目中的“读码器”。 以上内容仅供参考,建议查阅生物专业书籍或文献获取更准确和全面的信息。
2023年01月30日,香港中文大学医学院于君教授团队以“Targeting m6A reader YTHDF1 augments antitumour immunity and boosts anti-PD-1 efficacy in colorectal cancer”为题在《Gut》杂志发表研究论文,研究通过甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-seq)、RNA测序(RNA-seq)和核糖体测序(Ribo-seq)鉴定出YTHDF1的直接靶标,...
N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine, m6A)是真核生物mRNA中最丰富的化学修饰,在基因表达调控中发挥着重要作用,包括转录调控和转录后调控。m6A是一种可逆修饰,分别由甲基转移酶(writer)、去甲基化酶(eraser)和m6A结合蛋白(reader)进行添加、去除和识别。 m6A检测技术的发展是研究m6A功能的基础。薄层色谱(TLC)、斑点印迹(...
m6A 修饰有三类调节器：Writer甲基转移酶 (MTC)，负责催化，例如 METTL3、METTL14 和 WTAP；Eraser去甲基化酶 (Demethylase)，负责去除甲基化，例如 FTO 和 ALKBH5；Reader直接识别和结合 m6A 位点，使 m6A 修饰的 RNA 发挥特定的作用，主要包括 YTHDC1、YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3 等。YTHDF：一种 m6A “阅读...
使用cBioPortal和GISTIC2.0分析了m6A调节蛋白的遗传学改变,约11.9%的临床样本(204/1710)发生了m6A调节蛋白基因扩增,近4.6%的样本(79/1710)有基因组突变。一些reader蛋白、YTHDF1、YTHDF3和HNRNPA2B1显示出相对较高的拷贝数扩增频率。(Fig.1D) Fig.1
RNA的m6A修饰涉及三种类型的调控因子:甲基转移酶(writer)、脱甲基酶(eraser)和m6A结合蛋白(reader)。 第一类是甲基转移酶(writer),它催化甲基化的发生,在甲基转移酶的作用下,能对RNA上的腺嘌呤进行甲基化的修饰。 第二类是去甲基酶(eraser),在去甲基酶的作用下,能对已发生甲基化修饰的RNA位点产生去除甲基化的作...
细胞中有不同的m6A阅读蛋白(reader)可以识别mRNA上的m6A修饰,进而决定mRNA的命运,调控基因表达。近年来的大量研究表明m6A的异常与多种类型肿瘤发生,转移及耐药等病理过程密切相关。前期多篇报道分别揭示了m6A甲基转移酶复合体中METTL3【1, 2】、METTL14【3】、WTAP【4】,去甲基化酶FTO【5】、ALKBH5【6,7】,...