据报道,在各种癌症类型中,YTHDF1上调与癌症不良预后相关,YTHFD1可促进肿瘤发生和癌症转移。然而,YTHDF1在肿瘤免疫微环境(tumour immune microenvironment,TIME)中的作用尚不清楚。 2023年01月30日,香港中文大学医学院于君教授团队以“Targeting m6A reader YTHDF1 augments antitumour immunity and boosts anti-PD-1...
因此,YTHDF1可以通过促进蛋白翻译来调节TNF-κB信号通路。由于YTHDF1的m6A reader功能,通过m6A免疫沉淀测序(MeRIP-seq)以鉴定m6A修饰的转录本。通过筛选参与TNF信号通路的mRNA m6A peaks,鉴定出两个p65 mRNA终止密码子周围的m6A位点(图5B),并通过MeRIP-qPCR进行验证(图5C)。通过RNA免疫沉淀(RIP)测序和抗YTHDF1抗体...
相反,其自身的解旋酶活性才是维持生殖细胞正常发育分裂的关键。并且YTHDC2的解旋酶活性可以通过其它的相互作用蛋白来进行调节,比如XRN1可以特异性地增强YTHDC2的解旋酶活性。单细胞转录组分析表明Ythdc2突变的生殖细胞可以由有丝分裂阶段...
N6-甲基腺苷(m6A)是最丰富的RNA修饰之一。m6A reader,如YTH N6-甲基腺苷RNA结合蛋白1/2/3(YTHDF1/2/3)、YTHDC1/2和IGF2BP1/2/3与m6A修饰的mRNA结合,以决定m6A修饰mRNA命运。YDHDF1、METTL3和ALKBH5等m6A调控因子已在癌症中得到深入研究。据报道,在各种癌症类型中,YTHDF1上调与癌症不良预后相关,YTHFD1可...
近日,北京大学化学与分子工程学院和北大-清华生命科学联合中心贾桂芳课题组在Plant Cell期刊发表了题为“The m6A reader ECT8 is an abiotic stress sensor that accelerates mRNA decay inArabidopsis”的研究。该研究结果揭示了ECT8作为盐胁...
图2 YTH N6-甲基腺苷RNA结合蛋白1(Ythdf1)敲除通过减少髓源性抑制细胞(MDSC)和增加同源肿瘤中的功能性T细胞来诱导抗肿瘤免疫,这种作用被CD8+ T细胞消耗逆转 4、肠道特异性Ythdf1敲入促进小鼠结直肠肿瘤发生并抑制抗肿瘤免疫 为验证YTHDF1在自发性结直肠肿瘤发生中的作用,作者构建肠道特异性的Ythdf1敲入小鼠(Ythd...
本研究中,作者首先发现了YTHDF1表达与IFN-γ的表达和CD8+T细胞浸润呈负相关,暗示了YTHDF1在结肠癌肿瘤微环境中的作用。通过在肿瘤模型上验证和scRNA-seq、MeRIP-Eseq、RNA-Eseq和Ribo-Eseq,证明了通过m6A-p65-CXCL 1/CXCR2轴抑制抗肿瘤免疫以促进结肠癌进展。该研究于2023年1月发表在《Gut》上,IF:24.5。
与DNA和组蛋白甲基化相似,m6A修饰是动态且可逆的,并发挥主要由“writers”、“erasers”和“reader”蛋白质介导的生物学效应(图2)。可逆性是指RNA可以在甲基转移酶的作用下甲基化,而在脱甲基酶的作用下脱甲基。 长期以来,“writers”由METTL3和METTL14蛋白质和它们的辅因子WTAP(肾母细胞瘤抑制基因-1相关蛋白)组成...
除了在转录后调控中的作用外,最近的研究表明m6A可以直接影响染色质状态和转录调控。在小鼠胚胎干细胞中,敲除m6A writer METTL3或核reader YTHDC1增加了染色质的可及性,并以m6A依赖的方式激活转录。此外,m6A去甲基化酶FTO的失活导致了更紧密的染色质。进一步的研究表明,METTL3在逆转录转座子上沉积m6A修饰,包括LINE...