m5C merip-seq结果显示,NSUN2敲除细胞中IRF3 mRNA的m5 C甲基化水平明显低于野生型细胞(图4d)。m5C meRIP-qPCR的结果显示,NSUN2敲除细胞中内源性m5 C甲基化的IRF3 mRNA水平明显低于野生型细胞,而外源性NSUN2的表达可显著提高内源性m5 C-甲基化的IRF3 mRNA水平(图4e)。随后,文章进一步通过RNA-seq数据分析了过...
(D) m5C-MeRIP qPCR检测NSUN2缺陷型视网膜母细胞瘤细胞中PFAS中m5C状态。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。 (E) qPCR数据显示NSUN2敲低后视网膜母细胞瘤细胞(Y79和WERI-RB1)中PFAS的表达。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。*p<0.05,**...
(D) m5C-MeRIP qPCR检测NSUN2缺陷型视网膜母细胞瘤细胞中PFAS中m5C状态。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。 (E) qPCR数据显示NSUN2敲低后视网膜母细胞瘤细胞(Y79和WERI-RB1)中PFAS的表达。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。*p<0.05,**...
通过体外和体内功能获得和功能缺失实验研究了NSUN2对EGFR-TKI耐药性的影响。通过RNA测序(RNA-seq)、亚硫酸盐RNA测序(RNA-BisSeq)和m5C甲基化RNA免疫沉淀-qPCR(MeRIP-qPCR)鉴定了NSUN2参与EGFR-TKI耐药的靶基因。此外,通过功能拯救和嘌呤霉素掺入实验研究了NSUN2对靶基因表达的调控机制。 结果 RNA m5C高甲基化和...
(D) m5C-MeRIP qPCR检测NSUN2缺陷型视网膜母细胞瘤细胞中PFAS中m5C状态。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。 (E) qPCR数据显示NSUN2敲低后视网膜母细胞瘤细胞(Y79和WERI-RB1)中PFAS的表达。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。*p<0.05,*...
随后,作者用 m5C meRIP-qPCR 随机验证了几个涉及这些途径基因的mRNA m5C修饰情况,发现它们在肿瘤中的m5C修饰水平均上调(下图F),这与bsRNA-seq结果一致(下图G)。此外,这些基因的mRNA的m5C 水平与ESCC中NSUN2的RNA水平呈正相关(下图...
meRIP-qPCR 云序提供各类不同修饰的meRIP-qPCR服务,可针对mRNA,lncRNA,环状RNA等不同类型的RNA分子进行检测,低通量验证RNA修饰靶基因表达水平。 云序生物m6A修饰研究五大模块 01 m6A RNA修饰测序 m6A RNA修饰测序(m6A-meRIP-seq) 对m6A RNA甲基化,目前最流行的检测手段为m6A-MeRIP-Seq技术,适用于m6A RNA甲基化谱...
(D) m5C-MeRIP qPCR检测NSUN2缺陷型视网膜母细胞瘤细胞中PFAS中m5C状态。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。 (E) qPCR数据显示NSUN2敲低后视网膜母细胞瘤细胞(Y79和WERI-RB1)中PFAS的表达。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。*p<0.05,*...
优势四:**提供m5C一站式服务:m5C整体水平检测、m5C-seq、MeRIP-qPCR验证、RIP和RNA pull-down等。 优势五:率先研发超微量MeRIP测序技术,RNA量低至500ng起。 优势六:提供多种RNA修饰测序服务,包含m6A、m5C、m1A、m7G、m3C、m6Am、O8G、ac4C乙酰化和2'-O-甲基化测序。
通过体外和体内功能获得实验和功能丧失试验研究了NSUN2对EGFR-TKI耐药性的影响。通过RNA测序(RNA-seq)、亚硫酸盐RNA测序(RNA-BS)和m5C甲基化RNA免疫沉淀qPCR(MeRIP-qPCR)鉴定NSUN2参与EGFR-TKI耐药的靶基因。此外,通过功能拯救实验和嘌呤霉素掺入实验研究了NSUN2对靶基因表达的调控机制。