m5C merip-seq结果显示,NSUN2敲除细胞中IRF3 mRNA的m5 C甲基化水平明显低于野生型细胞(图4d)。m5C meRIP-qPCR的结果显示,NSUN2敲除细胞中内源性m5 C甲基化的IRF3 mRNA水平明显低于野生型细胞,而外源性NSUN2的表达可显著提高内源性m5 C-甲基化的IRF3 mRNA水平(图4e)。随后,文章进一步通过RNA-seq数据分析了过...
m5C merip-seq结果显示,NSUN2敲除细胞中IRF3 mRNA的m5 C甲基化水平明显低于野生型细胞(图4d)。m5C meRIP-qPCR的结果显示,NSUN2敲除细胞中内源性m5 C甲基化的IRF3 mRNA水平明显低于野生型细胞,而外源性NSUN2的表达可显著提高内源性m5 C-甲基化的IRF3 mRNA水平(图4e)。随后,文章进一步通过RNA-seq数据分析了过...
(D) m5C-MeRIP qPCR检测NSUN2缺陷型视网膜母细胞瘤细胞中PFAS中m5C状态。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。 (E) qPCR数据显示NSUN2敲低后视网膜母细胞瘤细胞(Y79和WERI-RB1)中PFAS的表达。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。*p<0.05,**...
(E)采用MeRIP-qPCR分析来证明在NSUN 6敲低细胞和相应的NC细胞中NSUN 6介导的NDRG 1 m5 C修饰。 (F-G)通过RT-qPCR(F)和蛋白质印迹(G)评估NSUN 6敲减后NDRG 1的表达。 (H-I)RT-qPCR检测NSUN 6敲减、NSUN 6过表达和相应对照细胞中NDRG 1 mRNA的半衰期。用放线菌素D(4 µg/mL)处理细胞3、6...
技术平台:功能实验、质粒转染、RNA-BS、mRNA-seq、MeRIP-qPCR、Western blot等 样本:人肺腺癌细胞系PC-9、HCC827、HCC2935、HCC4006、H1650、HCC2279、H1975细胞,药物敏感或固有耐药EGFR-TKI的NSCLC患者肺腺癌组织 研究摘要: 该研究通过在非小细胞肺癌(NSCLC)细胞系和患者样本中检测RNA m5C甲基化、m5C writer NOP2...
技术平台:功能实验、质粒转染、RNA-BS、mRNA-seq、MeRIP-qPCR、Western blot等 样本:人肺腺癌细胞系PC-9、HCC827、HCC2935、HCC4006、H1650、HCC2279、H1975细胞,药物敏感或固有耐药EGFR-TKI的NSCLC患者肺腺癌组织 研究摘要: 该研究通过在非小细胞肺癌(NSCLC)细胞系和患者样本中检测RNA m5C甲基化、m5C writer NOP2...
通过体外和体内功能获得实验和功能丧失试验研究了NSUN2对EGFR-TKI耐药性的影响。通过RNA测序(RNA-seq)、亚硫酸盐RNA测序(RNA-BS)和m5C甲基化RNA免疫沉淀qPCR(MeRIP-qPCR)鉴定NSUN2参与EGFR-TKI耐药的靶基因。此外,通过功能拯救实验和嘌呤霉素掺入实验研究了NSUN2对靶基因表达的调控机制。
(D) m5C-MeRIP qPCR检测NSUN2缺陷型视网膜母细胞瘤细胞中PFAS中m5C状态。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。 (E) qPCR数据显示NSUN2敲低后视网膜母细胞瘤细胞(Y79和WERI-RB1)中PFAS的表达。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。*p<0.05,*...
(D) m5C-MeRIP qPCR检测NSUN2缺陷型视网膜母细胞瘤细胞中PFAS中m5C状态。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。 (E) qPCR数据显示NSUN2敲低后视网膜母细胞瘤细胞(Y79和WERI-RB1)中PFAS的表达。数据三个生物学重复是平均值±SD。显著性由非配对双尾学生t检验确定。*p<0.05,*...
通过体外和体内功能获得和功能缺失实验研究了NSUN2对EGFR-TKI耐药性的影响。通过RNA测序(RNA-seq)、亚硫酸盐RNA测序(RNA-BisSeq)和m5C甲基化RNA免疫沉淀-qPCR(MeRIP-qPCR)鉴定了NSUN2参与EGFR-TKI耐药的靶基因。此外,通过功能拯救和嘌呤霉素掺入实验研究了NSUN2对靶基因表达的调控机制。