准确和系统地检测转录组范围mRNA m5C水平一直具有挑战性,缺乏对m5C修饰丰度和分布一致性观点。为了克服这一挑战,2019年研究人员基于富集mRNA的RNA亚硫酸盐测序(BS-seq)可以稳健的鉴定和定量分析mRNA m5C位点。RNA-BS通常在成年哺乳动物组织中只鉴定出几百个mRNA m5C位点,这些有限的位点分类为两种类型:Type I m5C位点...
为了推动mRNA m5C修饰研究,表观生物新推出单碱基分辨率的mRNA m5C BS-seq技术服务。该技术使用重亚硫酸盐对不含修饰的C进行处理,使其在PCR之后转换为T,而m5C修饰并不能进行该转换。结合体外合成全转录组无修饰RNA技术,在mRNA m5C BS-seq中加入IVT RNA作为负对照,得到高置信度的m5C位点,降低了检测结果中的假阳性...
准确和系统地检测转录组范围mRNA m5C水平一直具有挑战性,缺乏对m5C修饰丰度和分布一致性观点。为了克服这一挑战,2019年研究人员基于富集mRNA的RNA亚硫酸盐测序(BS-seq)可以稳健的鉴定和定量分析mRNA m5C位点。RNA-BS通常在成年哺乳动物组织中只鉴定出几百个mRNA m5C位点,这些有限的位点分类为两种类型:Type I m5C位点...
为了克服这一挑战,2019年研究人员基于富集mRNA的RNA亚硫酸盐测序(BS-seq)可以稳健的鉴定和定量分析mRNA m5C位点。RNA-BS通常在成年哺乳动物组织中只鉴定出几百个mRNA m5C位点,这些有限的位点分类为两种类型:Type I m5C位点和Type II m5C位点。Type I m5C位点包含下游富含G的三联体motif,位于发夹结构的5'端,由NSU...
为了克服这一挑战,2019年研究人员基于富集mRNA的RNA亚硫酸盐测序(BS-seq)可以稳健的鉴定和定量分析mRNA m5C位点。RNA-BS通常在成年哺乳动物组织中只鉴定出几百个mRNA m5C位点,这些有限的位点分类为两种类型:Type I m5C位点和Type II m5C位点。Type I m5C位点包含下游富含G的三联体motif,位于发夹结构的5'端,由N...
为了克服这一挑战,2019年研究人员基于富集mRNA的RNA亚硫酸盐测序(BS-seq)可以稳健的鉴定和定量分析mRNA m5C位点。RNA-BS通常在成年哺乳动物组织中只鉴定出几百个mRNA m5C位点,这些有限的位点分类为两种类型:Type I m5C位点和Type II m5C位点。Type I m5C位点包含下游富含G的三联体motif,位于发夹结构的5'端,由N...
为了克服这一挑战,2019年研究人员基于富集mRNA的RNA亚硫酸盐测序(BS-seq)可以稳健的鉴定和定量分析mRNA m5C位点。RNA-BS通常在成年哺乳动物组织中只鉴定出几百个mRNA m5C位点,这些有限的位点分类为两种类型:Type I m5C位点和Type II m5C位点。Type I m5C位点包含下游富含G的三联体motif,位于发夹结构的5'端,由N...
为了克服这一挑战,2019年研究人员基于富集mRNA的RNA亚硫酸盐测序(BS-seq)可以稳健的鉴定和定量分析mRNA m5C位点。RNA-BS通常在成年哺乳动物组织中只鉴定出几百个mRNA m5C位点,这些有限的位点分类为两种类型:Type I m5C位点和Type II m5C位点。Type I m5C位点包含下游富含G的三联体motif,位于发夹结构的5'端,由N...
相关方法:tRNA m5C BS-seq 图tRNA 第34位 m5C 和 f5C 修饰示意图 线粒体 tRNAMet 上的 m5C 和 f5C 修饰 研究者在重亚硫酸盐测序(BS-seq, bisulfite sequencing)的基础上进行了改进,实现了对 m5C 和 f5C 两种 RNA 修饰同时进行单碱基分辨率的检测。作者使用该方法对多种*细胞进行了测序,测序结果显示,tRN...
RNA-BS-seq(RNA亚硫酸盐测序)在m5C修饰检测中发挥着重要作用 A.确认m5C修饰的存在 在RNA-BS-seq技术出现之前,由于检测方法的限制,研究人员无法精确验证mRNA中是否存在m5C修饰。早期的研究主要集中在tRNA和rRNA中的m5C修饰,而对mRNA中的m5C修饰知之甚少。而RNA-BS-seq通过亚硫酸盐处理将未修饰的胞嘧啶(C)转化为尿...