高灵敏度和临床适用性——EDD-5hmC检测法,该方法通过酶切富集糖基化的5hmC,然后利用APOBEC(载脂蛋白B mRNA编辑催化多肽样)介导的脱氨基作用,有效区分各种胞嘧啶(C)修饰状态,实现了极高特异性的5hmC定量,使非特异性扩增减少8M倍。
北京大学伊成器及康奈尔大学朱晨旭共同通讯在Nature Biotechnology上发表题为“Simultaneous single-cell analysis of 5mC and 5hmC with SIMPLE-seq”的文献,该研究提出了一种在单细胞、单分子水平上同时检测5mC和5hmC的测序技术—SIMPLE-seq。该技术使用两个正交标记步骤将靶向修饰(5mC和5hmC)转化为两种胸腺嘧啶(T...
深圳市艾斯基因科技有限公司是一家专注于基因科技领域的创新企业,为客户提供深入研究5hmC化学捕获测序 (5hmC Seal-seq)方面学术研究相关服务.联系方式:0755-28507994.
2023年8月28日,宾夕法尼亚大学吴昊实验室在Nature Biotechnology杂志在线发表了研究论文Joint single-cell profiling resolves 5mC and 5hmC and reveals their distinct gene regulatory effects,报道了一种同时检测基因组DNA 5hmC和5mC修...
动态的5-甲基胞嘧啶(5mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)DNA修饰以细胞类型特异性的方式调节基因表达,并与各种生物过程相关,但尚未在同一基因组中同时在单细胞水平上测量这两种模式。 在这里,我们介绍SIMPLE-seq,这是一种可扩展的、基于碱基分辨率的方法,用于从数千个单细胞中联合分析5mC和5hmC。
作者首先将SIMPLE-seq技术应用于研究不同干性培养条件下的小鼠胚胎干细胞表观图谱差异,在单分子水平上鉴定了5mC与5hmC不同的分布关系,并基于此,以熵值定量描述了单个细胞内DNA表观修饰图谱的复杂度(cytosine modification entropy),解析了两...
DNA(羟)甲基化测序((h)MeDIP-seq)通过抗体富集高(羟)甲基化片段,并结合高通量测序平台,对所有富集的DNA片段进行高通量测序,研究人员能够获得全基因组范围内高精度的5mC/5hmC/6mA状态,为深入的表观遗传调控分析提供更有利的切入点。 服务名称 表观修饰 5mC- DNA甲基化测序(5mC-MeDIP-seq ) 5mC 5hmC...
Here we present SIMPLE-seq, a scalable, base resolution method for joint analysis of 5mC and 5hmC from thousands of single cells. Based on orthogonal labeling and recording of 'C-to-T' mutational signals from 5mC and 5hmC sites, SIMPLE-seq detects these two modifications from the same ...
DNA 5hmC 测序(化学法)简介 实验流程 优势 结果展示在人类基因组中,5mC占据总胞嘧啶的比例为2-8%,并且5mC修饰在很多生物学过程中,如基因表达、基因组稳定性维持、父母印记、X染色体失活、发育调控、衰老以及癌症的发生发展等生物学过程中发挥着不可替代的作用。5hmC作为5mC的氧化产物,主要存在于脑组织、神经...
Dynamic 5-methylcytosine (5mC) and 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) modifications to DNA regulate gene expression in a cell-type-specific manner and are associated with various biological processes, but the two modalities have not yet been measured simulta