为了推动mRNA m5C修饰研究,表观生物新推出单碱基分辨率的mRNA m5C BS-seq技术服务。该技术使用重亚硫酸盐对不含修饰的C进行处理,使其在PCR之后转换为T,而m5C修饰并不能进行该转换。结合体外合成全转录组无修饰RNA技术,在mRNA m5C BS-seq中加入IVT RNA作为负对照,得到高置信度的m5C位点,降低了检测结果中的假阳性...
RNA-BS-seq(RNA-Bisulfite-sequencing)是一种检测m5C的强有力技术。该技术利用重亚硫酸盐处理RNA,使RNA上没有发生修饰的C被转化为U,而发生m5C修饰的C碱基则保持为C。经PCR处理后,U转变成T,这样便将m5C与C区分开来。 易基因科技建立的升级版m5C RNA甲基化测序(RNA-BS-seq)服务,在经重亚硫酸盐处理RNA后,结合...
RNA甲基化(m5C)与人类疾病密切相关,其功能涉及调控干细胞应激、细胞毒性应激、mRNA出核和植物细胞发育及基因表达等方面。 RNA-BS-seq(RNA-Bisulfite-sequencing)是一种检测m5C的强有力技术。该技术利用重亚硫酸盐处理RNA,使RNA上没有发生修饰的C被转化为U,而发生m5C修饰的C碱基则保持为C。经PCR处理后,U转变成T,...
为了推动mRNA m5C修饰研究,表观生物最新推出单碱基分辨率的mRNA m5C BS-seq技术服务。该技术使用重亚硫酸盐对不含修饰的C进行处理,使其在PCR之后转换为T,而m5C修饰并不能进行该转换。结合体外合成全转录组无修饰RNA技术,在mRNA m5C BS-seq中加入IVT RNA作为负对照,得到高置信度的m5C位点,降低了检测结果中的假阳...
RNA-BS-seq(RNA-Bisulfite-sequencing)是一种检测m5C的强有力技术。该技术利用重亚硫酸盐处理RNA,使RNA上没有发生修饰的C被转化为U,而发生m5C修饰的C碱基则保持为C。经PCR处理后,U转变成T,这样便将m5C与C区分开来。 易基因科技建立的升级版m5C RNA甲基化测序(RNA-BS-seq)服务,在经重亚硫酸盐处理RNA后,结合...
其主要测序研究方法包含基于抗体富集的 MeRIP-seq 法以及基于化学转化的BS-seq。f5C(5-甲酰胞嘧啶, 5-formylcytosine )是在 m5C 修饰的基础上进一步氧化得到的产物,该过程由 ALKBH1 酶催化。f5C 在早前的研究中见诸哺乳动物线粒体的 tRNA 当中。最近,德国癌症研究中心等机构的研究者在 Nature 杂志上发文揭示...
为了克服这一挑战,2019年研究人员基于富集mRNA的RNA亚硫酸盐测序(BS-seq)可以稳健的鉴定和定量分析mRNA m5C位点。RNA-BS通常在成年哺乳动物组织中只鉴定出几百个mRNA m5C位点,这些有限的位点分类为两种类型:Type I m5C位点和Type II m5C位点。Type I m5C位点包含下游富含G的三联体motif,位于发夹结构的5'端,由N...
RNA-BS-seq(RNA-Bisulfite-sequencing)是一种检测m5C的强有力技术。该技术利用重亚硫酸盐处理RNA,使RNA上没有发生修饰的C被转化为U,而发生m5C修饰的C碱基则保持为C。经PCR处理后,U转变成T,这样便将m5C与C区分开来。 易基因科技建立的升级版m5C RNA甲基化测序(RNA-BS-seq)服务,在经重亚硫酸盐处理RNA后,结合...
为了克服这一挑战,2019年研究人员基于富集mRNA的RNA亚硫酸盐测序(BS-seq)可以稳健的鉴定和定量分析mRNA m5C位点。RNA-BS通常在成年哺乳动物组织中只鉴定出几百个mRNA m5C位点,这些有限的位点分类为两种类型:Type I m5C位点和Type II m5C位点。Type I m5C位点包含下游富含G的三联体motif,位于发夹结构的5'端,由N...
基于化学诱导标记的亚硫酸盐测序(BS-seq)以检测m5C RNA修饰(图1b)已被开发用于表观转录组标记检测。亚硫酸盐处理将未甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),从而产生一种可以以单核苷酸分辨率下绘制m5C的标记。在植物中,BS-seq已用于检测tRNA、rRNA和mRNA中的m5C。