RNA-BiS-Seq分析显示,在NSUN2基因敲除组中,不同染色体和基因区域的甲基化水平显著降低(图3F)。RNA-BiS-Seq和RNA-Seq的综合分析表明,与对照组相比,NSUN2基因敲除CRC细胞中ENO1的m5C甲基化和mRNA水平显著降低(图3G)。研究人员分析了NSUN2介导的m5C修饰对ENO1的影响。RT-qPCR分析和Western Blot分析结果表明,NSUN...
此外,通过RNA-BisSeq、RNA-seq、RIP-seq和ChIP-seq等技术分析了NSUN2介导的基因表达调控,并验证E2F1在NSUN2介导的卵巢癌进展中发挥至关重要的作用。 研究结果 (1)NSUN2在卵巢癌组织中过表达,NSUN2过表达与卵巢癌症患者预后不良相关 为研究m5C修饰在卵巢癌症中的作用,作者分析了14种m5C调控因子在TCGA队列中的表...
本研究通过m5C bis-seq分析,证实了NSUN2在胃癌中表达上调并与不良预后相关,并通过测定了m5C在GC mRNA中的分布,发现m5C修饰的基因主要参与了多种癌症相关的信号通路,SUMO化修饰-NSUN2-m5C轴可能是胃癌和泛癌治疗的一个新的诊断和治疗靶点(图7 )。 图7 SUMO-2/3-NSUN2-m5C修饰在胃癌中的功能景观模型 云序生...
RNA-BiS-Seq分析显示,在NSUN2基因敲除组中,不同染色体和基因区域的甲基化水平显著降低(图3F)。RNA-BiS-Seq和RNA-Seq的综合分析表明,与对照组相比,NSUN2基因敲除CRC细胞中ENO1的m5C甲基化和mRNA水平显著降低(图3G)。研究人员分析了NSUN2介导的m5C修饰对ENO1的影响。RT-qPCR分析和Western Blot分析结果表明,NSUN...
研究通过RNA-Bis-seq等分析鉴定出m5C甲基转移酶NSUN2在CRC中表达水平升高及其在CRC中的致癌作用,以及潜在的遗传和分子机制。NSUN2诱导的代谢重编程以m5C依赖性方式调控ENO1表达增强葡萄糖代谢,导致CRC细胞中乳酸产生增加。此外,乳酸不仅通过组蛋白H3K18乳酸化(H3K18la)激活NSUN2转录,还诱导NSUN2在Lys356残基(K356...
我们率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫酸盐处理的方式进行测序(Bisulfite Sequencing, 简称 Bis-seq)。在全转录范围内及tRNA水平查看基因m5C甲基化修饰水平。此外,我们亦提供 m5C 甲基化免疫沉淀测序(m5C Methylation Immunoprecipitation Sequencing,简称 m5C MeRIP-seq)服务,助力 m5C 修饰研究。
(2)RNA-BisSeq揭示NSUN2促进卵巢癌症细胞m5C RNA修饰 鉴于已经证实NSUN2能够催化mRNA m5C修饰,作者首先通过免疫荧光染色检测了 NSUN2 在卵巢癌细胞中的定位。随后使用特异性靶向m5C修饰RNA的抗体进行斑点印迹实验,以确认 NSUN2 是否调控整体mRNA m5C修饰。为了确定由NSUN2介导的特异性mRNA m5C修饰,作者通过RNA-Bis...
m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C普遍存在,但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。我们率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫酸盐处理的方式进行测序(Bisulfite Sequencing, 简称 Bis-seq)。在全转录...
研究通过RNA-Bis-seq等分析鉴定出m5C甲基转移酶NSUN2在CRC中表达水平升高及其在CRC中的致癌作用,以及潜在的遗传和分子机制。NSUN2诱导的代谢重编程以m5C依赖性方式调控ENO1表达增强葡萄糖代谢,导致CRC细胞中乳酸产生增加。此外,乳酸不仅通过组蛋白H3K18乳酸化(H3K18la)激活NSUN2转录,还诱导NSUN2在Lys356残基(K356...
免疫荧光染色和GO分析揭示NSUN2在卵巢癌细胞中的定位和肿瘤相关调控通路。此外,通过RNA-BisSeq、RNA-seq、RIP-seq和ChIP-seq等技术分析了NSUN2介导的基因表达调控,并验证E2F1在NSUN2介导的卵巢癌进展中发挥至关重要的作用。 研究结果 (1)NSUN2在卵巢癌组织中过表达,NSUN2过表达与卵巢癌症患者预后不良相关...