本研究通过m5C bis-seq分析,证实了NSUN2在胃癌中表达上调并与不良预后相关,并通过测定了m5C在GC mRNA中的分布,发现m5C修饰的基因主要参与了多种癌症相关的信号通路,SUMO化修饰-NSUN2-m5C轴可能是胃癌和泛癌治疗的一个新的诊断和治疗靶点(图7 )。 图7 SUMO-2/3-NSUN2-m5C修饰在胃癌中的功能景观模型 云序生...
Bisulfite modification of DNA is the most commonly used, "gold standard" method for DNA methylation studies providing single nucleotide resolution. This technology is based on the chemical conversion of unmethylated cytosine to uracil. Methylated cytosines are protected from this conversion allowing to ...
The wide application of reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) and whole genome bisulfite sequencing (bis-seq) opens the door to study DNA ... Y Park,ME Figueroa,LS Rozek,... - 《Bioinformatics》 被引量: 107发表: 2014年 MethylSig: a whole genome DNA methylation analysis pipeline...
m5C MeRIP-seq转录组分析发现了未感染或sars-cov-2感染的Caco-2细胞中RNA的内源性m5C位点(图6a)。m5C Bis-seq分析发现(图6b),IRF3 mRNA中的一个甲基化胞嘧啶是甲基化的主要位点,在体外被重组NSUN2蛋白高度甲基化:5‘UTR中的C169(图6c)。此外,还发现了另外三个高度甲基化的胞嘧啶:3‘UTR中的C1569,CDS2...
Segmentation of Bis-seq dataLukas BurgerDimos Gaidatzis
180+ Java applications for analyzing next generation sequencing data from ChIPSeq, RNASeq, BisSeq, DNASeq, variant annotation/ filtering, alignment/VCF QC, capture array design, IGV/ DAS2/IGB/UCSC file manipulation, etc. Both GUI and cmd line interfaces....
一、钟婧婧担任职务:钟婧婧目前担任山东畅旅国际旅游发展有限公司法定代表人,同时担任山东畅旅国际旅游发展有限公司执行董事兼总经理;二、钟婧婧的商业合作伙伴:基于公开数据展示,钟婧婧目前有4个商业合作伙伴,包括冷冬、冷冰、钟婧婧等。 财产线索 线索数量 老板履历 图文概览商业履历 任职全景图 投资、任职的关...
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Aaron is 6'2" and wears a sizeMtop and sizeSmatching shorts. Lyla is 5' 9 1/2" with bust/waist/hips of 34''/25''/36'' and wears a size 6 US dress. She is wearing a sizeMof our 'Cabannabis' Cabana Shirt for an oversized look....
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