2023年1月12号,NatureMethod报道2022年最值得关注的方法——长读段测序(Long-read sequencing)。 今年6月,Nature Method上发表关于一篇T2T的文章,并强调端粒到端粒(T2T)联盟成功地提出了第一个完整的人类基因组。这一成就是通过广泛的实验和计算努力取得的。其中,长读测序是负责生成T2T数据的主要测序技术,可以说为...
目前这里有大量不同的DNA和RNA修饰,好多都是没有被检测到和研究的,长读长测序为研究这些修饰的分布和功能打开了新的大门。 Lucas, M.C., Novoa, E.M. Long-read sequencing in the era of epigenomics and epitranscriptomics.Nat Methods20, 25–29 (2023).https://doi.org/10.1038/s41592-022-01724-8 ...
作为“更亲和”的测序技术，长读长测序也正在不断为方法开发和生物学研究开辟新的领域，例如机器学习等前沿技术正日益成为长读长测序数据分析工具箱的核心要素。齐碳科技是国内首家自主研发出纳米孔基因测序仪并率先开启商业化的企业，目前已有上百家机构用户使用齐碳QNome测序平台，涵盖国内领先的科研院所、高校、医院...
其中,precisionFDA的挑战框架是该平台最具开放性的功能之一,它支持在公开环境中举办生物数据挑战,并提供必要的资源以便进行测试和验证。 在2016年,首届瓶中基因组(GIAB)-precisionFDA真相挑战赛正式启幕,挑战参赛者从两个GIAB样本的短读长数据中识别出小变体。虽然HG001(也被称为NA12878)的基准测试数据已提前公布,但当...
Long-read sequencing, also known as third generation sequencing, is an emerging technique that allows for the sequencing of longer DNA segments leading to improved detection of structural variants and epigenetics. These capabilities are opening a way for better characterization of brain tumors. Here, ...
2022年2月,国际顶级期刊Nature发布了【2022年度值得关注的七大顶尖生物技术榜单】,并评述这七大顶尖生物技术有望在本年对科学研究产生重大影响,长读长测序技术赫然在榜。 4月,人类基因组测序便迎来第18座里程碑——迄今最完整的人类基因组图谱发布!其中,长读长测序正是负责端粒到端粒数据的主要测序技术,以其长读长...
Iyer, Sara Goodwin, and William Richard McCombie Abstract: “Long-read sequencing technologies have improved the contiguity and, as a result, the quality of genome assemblies by generating reads long enough to span and resolve complex or … more »...
长读测序(Long-Read Sequencing,LRS),即第三代DNA测序技术,可以绘制更加完整的人类基因组图谱。下一代DNA测序是基因组革命背后的驱动力。虽然短读测序(Short-Read Sequencing,SRS)在过去占主导地位,但ARK认为,长读测序将迅速获取市场份额。 ARK认为,与短读测序相比,长读测序技术可以提供更高的准确性、更全面的变体...
Another dimension of advancement has been the emergence of long-read sequencing platforms that can sequence longer individual DNA molecules. These so-called “third generation” platforms, such as PacBio and Oxford Nanopore long read technologies, have evolved to a cost per acquired base that now ...
PacBio incorporated the NVIDIA A100 Tensor Core GPU into its Revio system to accelerate the speed and accuracy of long‑read sequencing, while minimizing costs.