这意味着,extra设置只会在第一次数据文件读取时生效,此后它们将不再影响系统。 4.add关键字的使用 多个数据文件的读取: 如果你使用add选项来向现有的模拟系统中添加原子(例如通过read_data命令添加新数据文件),在读取数据文件时,你需要确保数据文件的顺序和结构一致性。也就是说,如果你添加了新的原子或分子,extra...
对于read_data命令来说,如果模拟盒子还不存在,则不能使用add关键词;如果使用了creat_box命令或者先前的read_data命令存在模拟盒子,则必须使用add关键词。 如果第一个read_data命令定义了一个正交、限制三斜、一般三斜的模拟盒子,那么后续的数据文件中必须定义相同类型的模拟盒子。模拟盒子的类型必须保持一致。GPT同学来...
1. 确认LAMMPS是否支持读取多个data文件 LAMMPS支持通过多次使用read_data命令来读取多个data文件。这样可以在一个模拟中构建出由多个部分组成的复杂系统。 2. 查找LAMMPS官方文档中关于读取多个data文件的说明 在LAMMPS的官方文档中,read_data命令的语法和用法被详细描述。特别是,文档提到了可以通过使用add、offset、shift...
read_data Fe.data 1. read_data命令支持在一个lammps代码中读取多个data文件,将不同的结构组装为一个复杂的体系。 当然,复杂体系的建模也可以在建模软件里面完成,但有些情况下,使用read_data命令会更加灵活。 比如两部分结构分别进行弛豫,达到平衡以后再组合到一起,或者两部分结构是用两种建模软件建模,分别生成data...
offset的命令后，老出现非法定义的错误，我如果要读入data文件是另一个元素，应该在第一个read_data命令...
我想在原有模拟基础上增加一些模拟的粒子，就准备使用read_data add append offset这组指令，可是不知道...
read_datadata.lammps includePARM.lammps #分组 groupwattype12 groupCartype3 #固定水分子键角 fixmyshkwatshake1.0e-42000b1a1 fixmynveallnve #对水进行控温,温度计算去除流动方向的速度影响 computectNwattemp/partial011#onlythermalisethewaterusingddlnormaltothedirectionoftheflow ...
read_data NiCrCo.data(1) extra/atom/types 1 ##表示在Ni、Cr和Co原子的基础上增加C原子 ##轧辊原子模型的读取 read_data roller.data add append offset 1 0 0 0 0 shift 0.0 0.0 -134 ###定于原子质量 mass 1 58.69 # Ni mass 2 52 # Cr ...
read_data CPU = 0.645 seconds WARNING: Ignoring inactive control parameter: simulation_name (../...
然后,我们可以通过定义一个原子类型和键角类型,在输入文件中使用"read_data"命令来读取晶胞文件。在LAMMPS输入文件中,可以使用"pair_style"和"pair_coeff"命令定义键角的势函数和参数。 例如,我们可以将石墨烯晶胞文件命名为"graphene.data",在输入文件中添加以下命令来定义键角: ``` # Define the potential and...