首先如果采用第三方软件进行建模,模型文件需要转换成lammps可以识别的data文件。 我使用的是MS软件进行建模导出car文件,然后使用lammps中自带的建模命令“msi2lmp”将其转化为data文件,然后使用read_data命令调取信息。不过自己过程中该命令中出现多次报错,深感需要仔细阅读官方的帮助文档。read_data是lammps中较为核心的命...
此时,LAMMPS 会发现图像标志变得无效,因此会将所有非周期维度的图像标志重置为零。这样可以避免在后续操作中使用无效的图像标志导致意外的结果。 重置图像标志: LAMMPS 在读取数据文件时,会自动将所有非周期维度的图像标志设置为零,并打印警告信息。这意味着,如果原子跨越了周期性边界,LAMMPS 会将这些原子移回到模拟盒子...
read_data filekeyword args... 1. 如果只需要读取一个data文件,直接将文件名写到read_data命令的后面即可: read_dataFe.data 1. read_data命令支持在一个lammps代码中读取多个data文件,将不同的结构组装为一个复杂的体系。 当然,复杂体系的建模也可以在建模软件里面完成,但有些情况下,使用read_data命令会更加灵...
8.lammps创建data文件教学 LAMMPS包中的数据文件可以使用“write_data”命令生成。通过 LAMMPS 输入脚本生成数据文件后,可以使用“read_data”命令将该文件导入到另一个输入脚本中。 #科研软件 #科研工具 - 科研小然于20240102发布在抖音,已经收获了534个喜欢,来抖音,记
// clang-format on #else #ifndef LMP_READ_DATA_H #define LMP_READ_DATA_H #include "command.h" namespace LAMMPS_NS { class Fix; class ReadData : public Command { public: ReadData(class LAMMPS *); ~ReadData() override; void command(int, char **) override; static bool is_data_...
应该是data的问题，你好好检查一下data文件的格式 另外问一句，你是在linux系统下运行lammps吗？如果你的...
就准备使用read_data add append offset这组指令，可是不知道为什么，lammps报错illegal read_data command...
read_data Fe.data 1. read_data命令支持在一个lammps代码中读取多个data文件,将不同的结构组装为一个复杂的体系。 当然,复杂体系的建模也可以在建模软件里面完成,但有些情况下,使用read_data命令会更加灵活。 比如两部分结构分别进行弛豫,达到平衡以后再组合到一起,或者两部分结构是用两种建模软件建模,分别生成data...
LAMMPS命令 read_data read_data file keyword args ... keyword:add、offset、shift、extra/*/types、extra/*/per/atom【*为atom/bond/angle/dihedral/improper/bond】、group、nocoeff、fix 通过使用add、offset和shift关键字,可以多次使用此命令将新的原子及其属性添加到现有系统中。以下的细节也包括extra关键字...
很多同学对于在lammps中直接建出来的模型比较熟悉,直接用建模的region分组即可。 在一对一咨询过程中,发现有不少同学对于其它软件建好并通过read_data读入的模型,就不会分组了,也有同学知道分组方法,但是不会确定分组的region坐标范围,从而导致模拟结果出错。