首先如果采用第三方软件进行建模,模型文件需要转换成lammps可以识别的data文件。 我使用的是MS软件进行建模导出car文件,然后使用lammps中自带的建模命令“msi2lmp”将其转化为data文件,然后使用read_data命令调取信息。不过自己过程中该命令中出现多次报错,深感需要仔细阅读官方的帮助文档。read_data是lammps中较为核心的命...
在lammps模拟过程中,为方便对不同的原子施加不同的命令,需要进行分组操作。 很多同学对于在lammps中直接建出来的模型比较熟悉,直接用建模的region分组即可。 在一对一咨询过程中,发现有不少同学对于其它软件建好并通过read_data读入的模型,就不会分组了,也有同学知道分组方法,但是不会确定分组的region坐标范围,从而导致...
请教大家一个问题，我看lammps例句大多数是直接建结构，然后根据region block来分区域，分group。我想问...
弱弱的问一句，lammps中 read_data create_atom 能一起用吗？ 有没有人这么用过 ...
read_dataFe.data 1. read_data命令支持在一个lammps代码中读取多个data文件,将不同的结构组装为一个复杂的体系。 当然,复杂体系的建模也可以在建模软件里面完成,但有些情况下,使用read_data命令会更加灵活。 比如两部分结构分别进行弛豫,达到平衡以后再组合到一起,或者两部分结构是用两种建模软件建模,分别生成data...
在lammps模拟中,常用的建模方法有两种,一种是完全使用lammps自带命令建模,另一种是使用read_data命令读入其它软件模型。 在lammps模拟中,有时候也会同时使用以上两种方法:使用read_data读入模型文件后,再用lammps自带命令添加其它类型的原子。 如本例中,使用Atomsk建立了一个Cu基底模型,保存为Cu.lmp文件。
在上篇中,我们学习了read_data其中基本命令含义,以及帮助文档中的一小部分。这篇文章将衔接上一篇的末尾继续对帮助文档进行逐字逐句的学习,话不多说开始吧。 二、正文 数据文件中模拟盒子的规范 标题关键词列表三种lammps支持的模拟盒子: orthogonal box= faces are perpendicular to the xyz coordinate axes ...
extra关键字只能在第一次使用read_data命令时使用。如果您打算稍后使用附加的read_data命令添加新的atom、bond、angle等类型,那么它们非常有用。这是因为在初始化系统时,LAMMPS设置了允许的原子、键和角度等类型的最大数目。如果不使用extra关键字,那么这些类型的数量将限制于您读取的第一个数据文件中。例如,如果第一...
是别人实验三天弄成功的
lammps read_data 文件格式是怎么样的，能传一份给我看看吗?谢谢啊！