首先如果采用第三方软件进行建模,模型文件需要转换成lammps可以识别的data文件。 我使用的是MS软件进行建模导出car文件,然后使用lammps中自带的建模命令“msi2lmp”将其转化为data文件,然后使用read_data命令调取信息。不过自己过程中该命令中出现多次报错,深感需要仔细阅读官方的帮助文档。read_data是lammps中较为核心的命...
接受非零图像标志可能导致LAMMPS内部使用未包装坐标(例如计算一组原子的质心)的任何操作和计算产生意想不到的结果。因此,非周期维度的所有非零图像标志将在读取数据文件时重置为零,如果发生这种情况,LAMMPS将打印一条警告消息。这相当于在那个方向上把原子一个个包裹回主胞。该操作相当于change_box命令,用于修改周期。
read_dataFe.data 1. read_data命令支持在一个lammps代码中读取多个data文件,将不同的结构组装为一个复杂的体系。 当然,复杂体系的建模也可以在建模软件里面完成,但有些情况下,使用read_data命令会更加灵活。 比如两部分结构分别进行弛豫,达到平衡以后再组合到一起,或者两部分结构是用两种建模软件建模,分别生成data...
8.lammps创建data文件教学 LAMMPS包中的数据文件可以使用“write_data”命令生成。通过 LAMMPS 输入脚本生成数据文件后,可以使用“read_data”命令将该文件导入到另一个输入脚本中。 #科研软件 #科研工具 - 科研小然于20240102发布在抖音,已经收获了534个喜欢,来抖音,记
read_data Fe.data 1. read_data命令支持在一个lammps代码中读取多个data文件,将不同的结构组装为一个复杂的体系。 当然,复杂体系的建模也可以在建模软件里面完成,但有些情况下,使用read_data命令会更加灵活。 比如两部分结构分别进行弛豫,达到平衡以后再组合到一起,或者两部分结构是用两种建模软件建模,分别生成data...
LAMMPS命令 read_data read_data file keyword args ... keyword:add、offset、shift、extra/*/types、extra/*/per/atom【*为atom/bond/angle/dihedral/improper/bond】、group、nocoeff、fix 通过使用add、offset和shift关键字,可以多次使用此命令将新的原子及其属性添加到现有系统中。以下的细节也包括extra关键字...
read_data命令支持在一个lammps代码中读取多个data文件,将不同的结构组装为一个复杂的体系。 当然,复杂体系的建模也可以在建模软件里面完成,但有些情况下,使用read_data命令会更加灵活。 比如两部分结构分别进行弛豫,达到平衡以后再组合到一起,或者两部分结构是用两种建模软件建模,分别生成data文件后,使用read_data可以...