使用write_data命令保存data文件,在ovitio中可视化后可以用于验证模型是否准确。 举例如下: write_data Al_model.xyz 13、timestep 设置模拟的时间步长,金属中一般是在atomic单位制下,所以timestep的单位一般是ps。 举例如下: timestep 0.001 这里设置的是0.001ps,也就是1fs。 14、velocity 用来创建初始温度,或者理...
lammps入门创建data文件 LAMMPS中的数据文件可以使用“write_data”命令生成。通过 LAMMPS 输入脚本生成数据文件后,可以使用“read_data”命令将该文件导入到另一个输入脚本中。
14.LAMMPS分子动力学入门-写入data文件 LAMMPS软件中的“write_datafile”命令用于将分子动力学模拟的配置输出到数据文件。数据文件包含有关模拟框、原子类型、质量和坐标的信息,可用作后续模拟或分析的输入。#分子动力 - 科研小然于20240115发布在抖音,已经收获了513个喜
LAMMPS中的数据文件可以使用“write_data”命令生成。通过 LAMMPS 输入脚本生成数据文件后,可以使用“read_data”命令将该文件导入到另一个输入脚本中。 发布于 2024-01-02 16:04・IP 属地河南 LAMMPS 科研软件 科研学习 打开知乎App 在「我的页」右上角打开扫一扫 ...
8.lammps创建data文件教学 LAMMPS包中的数据文件可以使用“write_data”命令生成。通过 LAMMPS 输入脚本生成数据文件后,可以使用“read_data”命令将该文件导入到另一个输入脚本中。 #科研软件 #科研工具 - 科研小然于20240102发布在抖音,已经收获了534个喜欢,来抖音,记
write_data tip41.data #输出 write_restart tip41.restart 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24. 25. 26. 27. 28. 29. 30. 31. 32. 33. 34. 35. 36. ...
9. 频繁使用write_data,可视化、检查模型 08 LAMMPS金属in文件详解(2) 1. OVITO可视化注意事项 2. reset_timestep的含义 3. 对原子施加初速度(某一温度下) 4. 能量最小化方法:CG和SD(默认CG) 5. npt系综下进行弛豫 6. 系统信息的随时输出、观察 ...
write_data all1.data #move ball displace_atoms ball move 0 0 -30 units box #save data write_data all2.data 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24. 如果在使用lammps过程中遇到什么问题,可到公众号或者QQ群留言。
这样程序run的时候,会轮流写入断点到1,2两个文件中,第一个1000步写入1,那么下个1000步会写入2,然后下个写入1,一次类推。这样即使是断电时正在写其中一个断点,导致其不完整,但另外一个断点可以保证完整的。而且不会大量写restart文件。所以是设置断点的标配方式;除此之外,可以在run后写个write_data文件。保证模拟...
read_data 121210.data #将type为1的原子转换为其他原子 set type 2 type/ratio 3 0.086 87393 set type 1 type/ratio 4 0.02143 87393 #设置原子类型 write_data YSZ-121210.data 需要手动删除空位4号原子,自己添加电荷、微调原子数目等,后处理可以采用origin+Excel,适合具有一定大小的超晶胞。