使用write_data命令保存data文件,在ovitio中可视化后可以用于验证模型是否准确。 举例如下: write_data Al_model.xyz 13、timestep 设置模拟的时间步长,金属中一般是在atomic单位制下,所以timestep的单位一般是ps。 举例如下: timestep 0.001 这里设置的是0.001ps,也就是1fs。 14、velocity 用来创建初始温度,或者理...
14.LAMMPS分子动力学入门-写入data文件 LAMMPS软件中的“write_datafile”命令用于将分子动力学模拟的配置输出到数据文件。数据文件包含有关模拟框、原子类型、质量和坐标的信息,可用作后续模拟或分析的输入。#分子动力 - 科研小然于20240115发布在抖音,已经收获了513个喜
8.lammps创建data文件教学 LAMMPS包中的数据文件可以使用“write_data”命令生成。通过 LAMMPS 输入脚本生成数据文件后,可以使用“read_data”命令将该文件导入到另一个输入脚本中。 #科研软件 #科研工具 - 科研小然于20240102发布在抖音,已经收获了534个喜欢,来抖音,记
LAMMPS中的数据文件可以使用“write_data”命令生成。通过 LAMMPS 输入脚本生成数据文件后,可以使用“read_data”命令将该文件导入到另一个输入脚本中。 发布于 2024-01-02 16:04・IP 属地河南 LAMMPS 科研软件 科研学习 打开知乎App 在「我的页」右上角打开扫一扫 ...
第一种方式是使用lammps自带的建模命令建模,比如使用region命令划分区域,create_box命令生成模拟盒子,lattcie确定原子晶格常数,create_atoms生成原子。 使用命令行建模比较抽象,建模过程不是“所见即所得”,为了验证所建模型是否符合要求,可以在建模代码的后面使用write_data命令把模型保持为data文件,在lammps中运行in文件,...
1.Lammps官网命令,写in data文件时注意看:https://lammps.sandia.gov/doc/Commands_all.html http://2.in文件包括四个部分:初始值,定义原子和盒子,设定条件,run 大致了解这些命令如下: lattice(晶格参数),region(选择一个而区域),create_box(创建一个盒子),create-atoms(创建原子)——通过这四个命令创建原子(...
write_data all2.data 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24. 如果在使用lammps过程中遇到什么问题,可到公众号或者QQ群留言。 公众号案例代码以及学习交流,请加QQ群:754749935 ...
此后的13命令对做高分子及无机非的模拟的需要额外关注 pair_write bond_style bond_coeff, angle_style angle_coeff, dihedral_style dihedral_coeff, improper_style improper_coeff, kspace_style, kspace_modify dielectric, special_bonds ---Seting--- neighbor, ** 截断半径相关的设置 neigh_modify, ** time...
命令简介 3—boundary 01:54 命令简介 4—atom_style 01:40 命令简介 5—lattice 01:42 命令简介 6—region 02:38 命令简介 7—create_box 01:32 命令简介 8—create_atoms 02:02 命令简介 9—pair_style 02:40 命令简介 10—pair_coeff 04:49 命令简介 11—write_data 02:21 【...