8.lammps创建data文件教学 LAMMPS包中的数据文件可以使用“write_data”命令生成。通过 LAMMPS 输入脚本生成数据文件后,可以使用“read_data”命令将该文件导入到另一个输入脚本中。 #科研软件 #科研工具 - 科研小然于20240102发布在抖音,已经收获了534个喜欢,来抖音,记
14.LAMMPS分子动力学入门-写入data文件 LAMMPS软件中的“write_datafile”命令用于将分子动力学模拟的配置输出到数据文件。数据文件包含有关模拟框、原子类型、质量和坐标的信息,可用作后续模拟或分析的输入。#分子动力 - 科研小然于20240115发布在抖音,已经收获了513个喜
使用命令行建模比较抽象,建模过程不是“所见即所得”,为了验证所建模型是否符合要求,可以在建模代码的后面使用write_data命令把模型保持为data文件,在lammps中运行in文件,用ovito观察一下模型是否正确。 第二种建模方式是使用其他软件进行可视化的建模,例如Material studio、Atomsk等软件,建模完成后转换为lammps可以识别data...
在某些lammps模拟中,需要设置固定层,为了能够清楚的显示固定层,通常需要把固 定层原子设定为不同颜色。 解决的方法有两种,最简单的一种方法是使用create_atoms时选择和基体原子不一样 的原子类型。 如果晶体结构是通过其他建模软件生成,直接由data文件读入,那么,刚才那种方法 就不适用了。 这种情况可以使用set命令改变...
restart, *输出restart文件，对应前面read-restart，data文件只有原子坐标，restart含有部分计算信息 ...
write_datasio2_a.data 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24. 25. 26. 27. 结果: 公众号案例代码以及学习交流,请加QQ群:236862503 扫描关注微信公众号:lammps加油站。
#设置摩尔质量 mass 1 63.55 mass 2 63.55 #保存模型 write_data Cu.data 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24. 25. 更多lammps教程,关注微信公众号:lammps加油站
这种改变边界位置的事情，我一般不用这个命令。你弛豫过后，可以在文件末用write_data命令把构型写入一个...
read_data,read_restart【读入】, restart,write_restart【输出】,如果能灵活运用这几个命令,会让你的模拟在突发事件下得到经济上的收获。其中命令里有两类通配 符,*表示时间步,%表示CPU编号。 2.全局热力学数据,也就是所谓的thermodynamic output,这些量是面向于系统的,而不是面向于某一类,某一组,原子的。一般...
最后输出data文件，可通过此命令 例如：topo writelammpsdata mysystem.data 完成后，一定要检查data文件...