file = name of file to write dump info to attribute1,attribute2,… = list of attributes for a particular style 举例如下: dump 1 all custom 1000 Al.xyz type x y z 其中1是用户指定的dump名字,all是关键字,意思对所有的原子施加后面的操作,custom是自定义输出,1000的意思是每1000步输出一次,输出...
write_data tip41.data #输出 write_restart tip41.restart
topo writelammpsdata in.data full 这样我们就得到了一个atom_style为full的结构文件。看一眼：(in....
这时候可以在弛豫代码后面使用write_restart命令,如:write_restart restart.equil4. read_restart命令:读取文件重启模拟比较简单,使用方法和read_data命令类似:read_restart restart.equil需要注意的是,并不是所有的模拟信息都保存在restart.equil文件中。比如fix命令就需要在新的模拟文件中重新设置,官方手册已经列举的很全...
1 LAMMPS并不是全部读完所有指令才执行,而是读一行执行一次,因此下面的两组语句是不同的: timestep 0.5 以下的两个模拟其步长均为0.5 fmsec run 100 run 100 run 100 第一个模拟采用缺省值步长为1 fmsec timestep 0.5 run 100 第二个采用步长为0.5 fmsec ...
1.Lammps官网命令,写in data文件时注意看:https://lammps.sandia.gov/doc/Commands_all.html 2.in文件包括四个部分:初始值,定义原子和盒子,设定条件,run 大致了解这些命令如下 #附断裂实例操作 :https://youtu.be/M8NPAk0Cs7Q lattice(晶格参数),region(选择一个而区域),create_box(创建一个盒子),create-at...
write_data Al_model.xzy#运行时间 timestep 0.001 #0.001ps(皮秒),每一步运行0.001Psvelocity all create 300 12345 #all是一个默认的关键字;300表示初始温度为300k, 123456代表随机种子,给每个原子创建初始速度fix 1 all npt temp 300 300 1 iso 0 0 1 ...
Dump: 将snapshots输出到文件。 WriteRestart: 输出到restart文件。 Timer: 记录MPI运行时间的信息,在运行结束时输出。常用命令简介★ atom_style 设置体系原子所具有的属性 (1) 将体系设置为不同的style,原子所具有的属性不同。默认为atomic。 (2) 根据自己所研究体系的性质判断可能涉及的原子属性进行设定。 (...
topo writelammpsdata in.data full 这样我们就得到了一个atom_style为full的结构文件。看一眼：(in....
这时候可以在弛豫代码后面使用write_restart命令,如:write_restart restart.equil4. read_restart命令:读取文件重启模拟比较简单,使用方法和read_data命令类似:read_restart restart.equil需要注意的是,并不是所有的模拟信息都保存在restart.equil文件中。比如fix命令就需要在新的模拟文件中重新设置,官方手册已经列举的很...