over 1e-06 to re-computed values,并且pair_write输出的势与输入用的table符合了。但是还是会有...
我们的建模过程是先建立10x10x10的FCC-Fe的超胞,然后按比例替换铁原子,最后得到组份相等的高熵合金CoCrCuFeNi,由于高熵合金的格点原子构型是无序的,因此我们需要建立大量的模型,筛选出能量最小的一个。大量建模中需要注意以下几个方面:(1)我们建模过程中按比例替换Fe原子时,需要给定随机数组,相同的随机数组...
力场的设置分两步,首先设置力场类型,如pair_style、bond_style、angle_style、dihedral_style、improper_...
// 所有pair类型的计算都是由force父类引出的 if (pair_compute_flag) force->pair->compute(eflag,vflag); else if (force->pair) force->pair->compute_dummy(eflag,vflag); // 根据不同粒子类型启动不同的计算 if (atom->molecular) { if (force->bond) force->bond->compute(eflag,vflag); if...
pair_style swpair_coeff * * mW.sw H2O (二)Core Commands and Result Analysis.The next step is to perform a relaxation of the system at 200 K.fix (三)模拟过程与结果解读在LAMMPS中,我们首先定义了粗粒化水模型所使用的SW势能参数。接着,通过简单的核心命令,将体系在200K温度下进行弛豫。这...
在此基础上运行LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)一个示例 比较单机运行和分布式运行的效率 实验环境 宿主机上创建三台虚拟机,统一配置如下: 安装系统:Ubuntu20.04 CPU 8核,内存16G 网卡1走管理流量,网卡2走计算流量,网卡3走NFS流量(通过不同的linux bridge互通) ...
style custom step temp pe etotal vol epair ebond eanglethermo 1000 # time interval for printing out "thermo" datafix fxlan all langevin 300.0 300.0 120 48279fix fxnph all nph x 0 0 1000 y 0 0 1000 couple xyrun 100000# -- Write Section --write_data system_after_npt...
因为是多体势,运行的速度直接和密度相关,分子越大、越密集,产生的pair就越多,越慢。使用16核,...
The change to the MS-MEAM in the meam pair style changes energies and forces for systems using L12 lattice settings (like the example included in LAMMPS, or the force style unit test). The reference data for these has been updated.
style, pair_coeff, pair_modify, pair_style, pair_write,special_bonds Settings: communicate, dipole, group, mass, min_ modify, min_style, neigh_modify, neighbor, reset_timestep, run_style, set, shape, timestep, velocity Fixes: fix, fix_modify, unfix Computes: compute, compute_modify, un...