可采用软力场pair_style soft 1.0 nve:fix mobile all nve/limit 0.1 同时调整 neighbor 方法二:对于初始几何图形中的过密接触,一个简单的测试是在读取/创建所有原子并完整定义pair_style后,在log文件中检查是否删除了原子。操作方法为在输入中添加以下行: read_data 5atomstest pair_style reaxff NULL pair_coef...
pair_style规定原子间势函数类型,用的是soft势函数。 E=A[1+cos(\frac{\pi r}{r_c})]~~~when~r<r_c soft势给定一个截断半径r_c,在这个半径球之外的原子不会受到力。1.0是参数,代表截断半径r_c pair_coeff是不同类型原子间的一些系数。两个星号表示这是对所有原子的参数设置,10.0是A值,具有能量量纲。
你的data文件里面有设置的pair等参数，这种情况，需要在read_data命令之前先定义势文件类型 如先写：pair...
以pair_style lj/cut/coul/cut为例，下面这三个我可以理解：pair_style lj/cut/coul/cut 10.0 ...
8pair_style tersoff #作用势类型,我们的仿真系统为Si, 所以用Tersoff三体作用势 9pair_coeff * * SiC_Lindsay.tersoff Si Si # 所用势的具体参数 10## 定义不同的group,后面的仿真中可能会对不同group进行不同的操作 11group left_end id <> 1 288 # 我们将输入文件中ID 为1到288 号之间的原子定义成...
以pair_style lj/cut/coul/cut为例，下面这三个我可以理解：pair_style lj/cut/coul/cut 10.0 ...
(命令:pair style, bond style, angle style, dihedral style, improper style, kspace style) 对相互作用势:L-J, Buckingham, Morse, Yukawa, soft, class2(COMPASS), tabulated. 带点对相互作用势:Coulombic, point-dipole. 多体作用势:EAM, Finnis/Sinclair EAM, modified EAM(MEAM), Stillinger-Weber, ...
请教一个lammps使用 pair_style lj/expand 势函数的问题。我的体系是有 bead-spring的珠子组合的聚合物...
(命令:pair style, bond style, angle style, dihedral style, improper style, kspace style) 对相互作用势:L-J, Buckingham, Morse, Yukawa, soft, class2(COMPASS), tabulated. 带点对相互作用势:Coulombic, point-dipole.多体作用势:EAM, Finnis/Sinclair EAM, modified EAM(MEAM), Stillinger-Weber, ...
pair_lj_gromacs_coul_gromacs.h pair_lj_smooth.cpp pair_lj_smooth.h pair_lj_smooth_linear.cpp pair_lj_smooth_linear.h pair_mie_cut.cpp pair_mie_cut.h pair_morse.cpp pair_morse.h pair_soft.cpp pair_soft.h pair_table.cpp pair_table.h pair_ufm.cpp pair_ufm.h pair_yukawa.cpp pair...