命令简介 3—boundary 01:54 命令简介 4—atom_style 01:40 命令简介 5—lattice 01:42 命令简介 6—region 02:38 命令简介 7—create_box 01:32 命令简介 8—create_atoms 02:02 命令简介 9—pair_style 02:40 命令简介 10—pair_coeff 04:49 命令简介 11—write_data 02:21 【...
modify->setup_pre_force(vflag); // 所有pair类型的计算都是由force父类引出的 if (pair_compute_flag) force->pair->compute(eflag,vflag); else if (force->pair) force->pair->compute_dummy(eflag,vflag); // 根据不同粒子类型启动不同的计算 if (atom->molecular) { if (force->bond) force-...
可以在建模代码的后面使用write_data命令把模型保持为data文件，在lammps中运行in文件，用ovito观察一下模...
improper_coeff, improper_style, kspace_modify, kspace_ style, pair_coeff, pair_modify, pair_style, pair_write,special_bonds Settings: communicate, dipole, group, mass, min_ modify, min_style, neigh_modify, neighbor, reset_timestep, run_style, set, shape, timestep, velocity Fixes: fix, fi...
dimension: 定义了两维或者三维模拟（默认是三维）。boundary: 定义了分子动力学体系使用的边界条件，例如周期性边界条件或者自由边界条件等。atom_style: 定义模拟体系中的原子属性，这一命令与力场设置的参数中的原子类型（atom type）不同。pair_style: 相互作用力场类型，例如范德化势或者硬球势等。
力场指令:angle_coeff, angle_style, bond_coeff, bond_style, dielectric, dihedral_coeff, dihedral_style, improper_coeff, improper_style, kspace_modify, kspace_style, pair_coeff, pair_modify, pair_style, pair_write, special_bonds 设定指令:communicate, dipole, group, mass, min_modify, min_style...
力场指令:angle_coeff, angle_style, bond_coeff, bond_style, dielectric, dihedral_coeff, dihedral_style, improper_coeff, improper_style, kspace_modify, kspace_style, pair_coeff, pair_modify, pair_style, pair_write, special_bonds 设定指令:communicate, dipole, group, mass, min_modify, min_style...
pair_coeff 1 1 0.066 3.5 pair_coeff 1 2 0.140 2.9 pair_coeff 2 2 0.210 2.96 #定义一对或多对原子类型的之间系数(非键相互作用) bond_coeff 1 268.0 1.529 #定义一种或多种键类型的键力场系数 angle_coeff 1 50.0 109.5 #定义一种或多种角类型的角力场系数 ...
7、, replicateForce fields: angle_coeff, angle_style, bond_coeff,bond_style, dielectric, dihedral_coeff, dihedral_style,improper_coeff, improper_style, kspace_modify, kspace_style, pair_coeff, pair_modify, pair_style, pair_write,special_bondsSettings: communicate, dipole, group, mass, min_modif...
Force fields: angle_coeff, angle_style, bond_coeff, bond_style, dielectric, dihedral_coeff, dihedral_style,improper_coeff, improper_style, kspace_modify, kspace_style, pair_coeff, pair_modify, pair_style, pair_write,special_bonds Settings: communicate, dipole, group, mass, min_modify, min_sty...