src/pair_lj_sdk_coul_long_gpu.cpp does not exist src/pair_lj_sdk_gpu.cpp does not exist src/pair_lj_sf_dipole_sf_gpu.cpp does not exist src/pair_lj_smooth_gpu.cpp does not exist src/pair_mie_cut_gpu.cpp does not exist src/pair_resquared_gpu.cpp does not exist src/pair_ufm_g...
occasional/extra = 1 0 0 (1) pair eam, half, perpetual pair build: half/bin/newton stencil: half/bin/3d/newton bin: standardMemory usage per processor = 18.9056 MbytesStep Temp E_pair E_mol TotEng Press 0 0 -113280 0 -113280 -0.027860371 Loop time of 0 on 1 procs for 0 steps w...
这段话提到extra bond per atom这种设置已经被弃用(deprecated),应该改为使用extra/bond/per/atom,同样适用于角度、二面角和失配。这个新的设置可以确保为新的原子属性(如键、角度等)预留空间。 如何工作: 在读取数据文件时,如果你预期在模拟中会添加新的原子属性(如键、角度等),就需要为它们分配足够的内存空间。...
如果没跟分子,不能从0开始 mass 1 15.9994 #原子类型,质量 mass 2 1.008 neighbor 2.0 bin #截断半径相关的东西 neigh_modify delay 0 every 1 check yes #邻近原子列表更新速度 pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.125 8.5 #相互作用势:原子编号类型, 键和角的相互作用势:OM距离 ,截断 pair_coef...
lammps算完后显示的时间报告中，正常应是pair类型计算最耗时，但4核时，显示comm损耗很大。
在./examples/CHGNET，我们可以看到开发者提供的输入样例inp.lammps，其中pair_style和pair_coeff格式如下...
4. 混合势函数书写 书写混合势函数时,用pari_style hybrid 关键字,将要用到的势函数全部列出即可,然后再pair_coeff 中定义势函数。 某段势函数值相同时:pair_coeff: pair_coeff 9*10 9*10 XXXX 所有势函数值相同时:pair_coeff: pair_coeff * * XXX...
units real atom_style atomic region box block 0 10 0 10 0 10 create_box 1 box create_atoms 1 box pair_style lj/cut 2.5 pair_coeff * * 1.0 1.0 neighbor 2.0 bin neigh_modify delay 10 fix 1 all nve run 10 variable e equal pe thermo 1 thermo_style custom step temp e python my_sc...
如果没跟分子,不能从0开始mass1 15.9994#原子类型,质量mass 2 1.008neighbor2.0 bin#截断半径相关的东西neigh_modify delay 0 every 1 check yes#邻近原子列表更新速度pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.125 8.5#相互作用势:原子编号类型, 键和角的相互作用势:OM距离 ,截断pair_coeff 1 1 ...
pair_style style args style可取:none/hybrid/coul/cut... args:特点style需要设置args 使用介绍 定义模拟过程中原子间对相互作用的类型。可以通过pair_coeff命令指定相关的系数。 默认设置 pair_style none 2.8bond_style命令 使用语法 bond_style style args ...