初始模型结构太差,原子重叠严重,导致部分数值超标 出现nan(往往也是上文错误4的原因) 方法一:提高能量最小化的精度,重新能量最小化。可能无法进行能量最小化 可采用软力场pair_style soft 1.0 nve:fix mobile all nve/limit 0.1 同时调整 neighbor 方法二:对于初始几何图形中的过密接触,一个简单的测试是在读取/...
1.ERROR: Unrecognized pair style 'reaxff' is part of the REAXFF package which is not enabled in this LAMMPS binary. (../force.cpp:279) ERROR: Unrecognized pair style 'reaxff' is part of the REAXFF package which is not enabled in this LAMMPS binary. (../force.cpp:279) 这是由于未...
例如,具有 Tersoff 电位的传统 LAMMPS 输入具有以下电位设置: pair_style tersoff pair_coeff * * BNC.tersoff C 若要使用深电位,请将以前的线路替换为: pair_style deepmd graphene-compress.pb pair_coeff * * 输入文件中的pair_style命令使用 DeePMD 模型来描述石墨烯系统中的原子相互作用。 graphene-compress....
pair_coeff 2 2 0.1584375 0.317 3.170 72.5 145.625 kspace_style ewald 1.0e-4 neighbor ...
试试看，一般情况下遇到0作分母情况就会出nan 请问lj势用的时候可以不涉及到具体的原子么？两种类型的...
Step Temp E_pair E_mol TotEng Press 0 0 472478.96 0 472478.96 ...
初始模型结构太差,原子重叠严重,导致部分数值超标 出现nan 提高能量最小化的精度,重新能量最小化。可能无法进行能量最小化 可采用软力场pair_style soft 1.0nve:fix mobile all nve/limit 0.1同时调整 neighbor WARNING: Proc sub-domain size < neighbor skin, could lead to lost atoms ...
电荷分配是首要任务。每个原子的电荷参数必须在数据文件或输入脚本中明确定义。比如TIP4P水模型的氧原子电荷设为-1.1128，氢原子为0.5564。常见的错误是忘记在pair_style命令中包含long关键字，这会导致库仑力计算失效。建议在data文件内用"Atoms"部分写明电荷值，或在input脚本中用set命令动态赋值。算法选择直接影响...
00009.0000 1.5000 4.0000 27.5134 79.5548 5.0191 7.05000.0000S121.1168 0.0000 NaN 14....
pair_coeff 2 2 0.1584375 0.317 3.170 72.5 145.625 kspace_style ewald 1.0e-5 neighbor ...