初始模型结构太差,原子重叠严重,导致部分数值超标 出现nan(往往也是上文错误4的原因) 方法一:提高能量最小化的精度,重新能量最小化。可能无法进行能量最小化 可采用软力场pair_style soft 1.0 nve:fix mobile all nve/limit 0.1 同时调整 neighbor 方法二:对于初始几何图形中的过密接触,一个简单的测试是在读取/...
用排除法，先建立一个最简单的模型测试一下，看看是不是模型问题问题！发自小木虫Android客户端 ...
Step 步数；Temp 温度； E_pair pair能量； E_mol 分子能量；TotEng 总能量； Press 压强请高手确认...
fix2all qeq/reax10.010.01e-6reax/c fix3alltemp/berendsen500.0500.0100.0 dump1all atom30dump...
Step Temp E_pair E_mol TotEng Press 0 0 472478.96 0 472478.96 ...
初始模型结构太差,原子重叠严重,导致部分数值超标 出现nan 提高能量最小化的精度,重新能量最小化。可能无法进行能量最小化 可采用软力场pair_style soft 1.0nve:fix mobile all nve/limit 0.1同时调整 neighbor WARNING: Proc sub-domain size < neighbor skin, could lead to lost atoms ...
AIMD 模拟也可以使用 Quantum ESPRESSO ( NGC 目录中的container提供)进行。 Quantum ESPRESSO 是一套基于密度泛函理论、平面波和赝势的开放源代码,用于 Nan oscale 的电子结构计算和材料建模。 QE 计算中使用了相同的石墨烯结构。以下命令可用于启动 AIMD 模拟: ...
pair_coeff 2 2 0.1584375 0.317 3.170 72.5 145.625 kspace_style ewald 1.0e-5 neighbor ...
pair_coeff 2 2 0.1584375 0.317 3.170 72.5 145.625 kspace_style ewald 1.0e-4 neighbor ...
Step Temp E_pair E_mol TotEng Press 0 0 nan 0 nan nan 之前在小木虫上求助过，...