基于hifi数据的基因组组装流程主要包括以下步骤: 1.数据准备:选择三代Pacbio的HIFI数据作为组装工作数据,将bam数据转化成fq数据,可以使用samtools或bedtools进行转换。 2. hifiasm运行组装基因组:参数选择可参考知乎作者强强学生信。 3.剪裁scaffolds:基于组装的scaffold,通过Hi-C数据,每个unplaced contig被分配到互作最强...