这时我们就可以把它转化为.hic文件,放到juicebox中就很好的可视化。 juicer中的pre命令是用来做这个事情的。只要你的数据符合pre命令处理的格式,这个就很简单。具体用法:https://github.com/aidenlab/juicer/wiki/Pre 但有时我们的Hic-pro的结果文件不符合pre的格式,就需要使用hicpro2juicebox.sh这个脚本进行处理。
基于高通量测序技术的Hicpro结果可视化软件是由南京集思慧远生物科技有限公司著作的软件著作,该软件著作登记号为:2023SR0618072,属于分类,想要查询更多关于基于高通量测序技术的Hicpro结果可视化软件著作的著作权信息就到天眼查官网!
请问前辈hicpro后的 call TAD 和call loop步骤能分享嘛？ 谢谢！！文章看了三篇不一样，也不详细 ...
结果解读的话，结果format在上面的manual有，一般HiC结果解读的话多读读文章，比如Rao 2014 那种。Visuali...
HiC-Pro的Github里有manual。结果解读的话，结果format在上面的manual有，一般HiC结果解读的话多读读文章...
看你数据咯， 如果是原位Hi-C， 利用率比较高， 数据比较干净的话，在100K 40K 20K都是可以call ...