1、安装 HiC-Pro的安装可参考github:这里 2、具体使用 其实HIiC-Pro的使用方法简单来讲主要有三个参数: $ /usr/local/bin/HiC-Pro_2.11.1/bin/HiC-Pro -i path/data -c path/config-hicpro.txt -o path/outfile -i 输入的是fastq文件所在路径,需要注意的是:文件路径是指fastq文件所在位置的上两层 如...
期间可通过,docker top或者htop等命令查看进程运行情况,或通过docker logs -f hicpro命令查看控制台日志,当然也可以查看analysis目录下 log 文件。 代码语言:javascript 复制 docker run--name=hicpro-d-v/mnt/cosfs/PM_XS05KF2020110270_55_MGI:/data nservant/hicpro/HiC-Pro_3.0.0/bin/HiC-Pro-c/data/E2...
测试数据已经建好了bed文件,在HiC-Pro-3.1.0/annotation目录下,HindIII_resfrag_hg19.bed。 第一列是序列名,这里不是原始输入的序列名,而是HiC-Pro自行指定的序列名,第二列和第三列相关,第三列是程序检测到的酶切位点对应序列的起始位置。例如,假设采用的酶是dnpii,那么参考基因组序列上GATC位点的起始位置。
HiC-Pro的Github里有manual。结果解读的话，结果format在上面的manual有，一般HiC结果解读的话多读读文章...
车机与手机通过 HiCar 进行连接后,手机的导航应用可以投屏到车机,直接在车机打开使用。 无线连接方法: 从手机屏幕顶部右侧下滑出控制中心,打开蓝牙开关。 点击车机屏幕上的 HUAWEI HiCar 图标或点击方向盘上的语音按键。 按照车机屏幕和手机提示操作,如:输入连接码等,完成连接。 有线连接方法: 您可以使用 USB 数据线...
多位网友买到残血版iPhone 14 Pro,只能使用单SIM卡 据报道,由于大量用户收到了单SIM卡槽的国行iPhone,苹果官网已推迟部分iPhone 14 Pro系列的发货时间。 iPhone 14 Pro系列支持双nano SIM卡,一张SIM卡放入托架的底部,另外一张SIM卡插入顶部的凹槽内。
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conda env create -f HiC-Pro-3.1.0/environment.yml # 激活 HiC-Pro Python 环境 conda activate HiC-Pro_v3.1.0 # 可选,AWS Ubuntu 需要安装 apt install g++ unzip # 生成配置,执行安装 make configure make 可以从 HicPro Release 页面获取新的版本:https://github.com/nservant/HiC-Pro/releases注意...
HiC-Pro的Github里有manual。结果解读的话，结果format在上面的manual有，一般HiC结果解读的话多读读文章...