Hi-C实验原理 1.6 二代文库构建及测序 二代文库进行片段筛选400-600bp的片段,实际插入片段长度为300-500bp 一般测序读长:PE150 二代测序 1.7 Hi-C实际文库类型 将HIC数据进行比对是会出现不同的比对情况,我们需要的是 。对单端匹配、多处比对、未比对的reads进行过滤。 对Hi-C文库构建中产生的多种分子类型,...
关于原理部分和更详细的介绍,见HiC-Pro: Hi-C数据预处理高效工具, 这里只介绍如何快速使用Singularity的HiC-Pro进行数据分析。 关键内容就是,config-hicpro.txt 里的文件路径信息都必须是绝对路径,否则默认都位于annotation目录下。切记,切记,切记。 第零步: Singularity的HiC-Pro镜像下载, ...
一、德国西门子IP-LXM10HI热水消毒HICEDI膜块超纯水膜堆原理 淡中阳离子向负极迁移透过阳膜,被浓室中的阴膜截留;苏伊士原GEEDI膜块型号E-Cell-MK-3产水3吨超纯水膜堆代理水中阴离子向正极方向迁移阴膜,被浓室中的阳膜截留,这样通过淡室的水中离子数逐渐减少,成为淡水,而浓室的水中,由于浓室的阴阳离子不断...
一、德国西门子IP-LXM18HI热水消毒HICEDI膜块超纯水膜堆原理 淡中阳离子向负极迁移透过阳膜,被浓室中的阴膜截留;苏伊士原GEEDI膜块型号E-Cell-MK-3产水3吨超纯水膜堆代理水中阴离子向正极方向迁移阴膜,被浓室中的阳膜截留,这样通过淡室的水中离子数逐渐减少,成为淡水,而浓室的水中,由于浓室的阴阳离子不断...
二、HiC-Pro 原理 HiC-Pro的比对mapping的原理如下图所示,我们拿到了Hi-C的测序数据,HiC-Pro设置好配置文件自动进行批量化处理流程 image HiC-Pro能够自动化的比对,标准化和构建相互作用矩阵,在处理多样化的测序数据时,HiC-Pro能够检测和自动过滤测序数量差的reads和无效的片段。