此外:geom_boxplot(outlier.size = 0.5) 和 geom_point(size = 0.5) 这两个函数中散点大小需要保持一致。 Step5:配对小提琴图 ggplot(data, aes(x = Group, y = Expression, color = Group)) + geom_violin(size = 1) + geom_line(aes(group = paired), color = "grey80", size = 0.5) + ...
R语言中，ggplot2可以用来绘制直观的小提琴图（violin plot），便于理解数据分布和差异。首先，确保数据中'surstat'列为factor类型，便于分析。1. 单个“两组”图绘制 以gene39为例，可以先尝试默认参数绘制，然后根据需要调整美观，如添加p值。利用ggpubr包可方便地插入p值，并用星号形式表示。 2....
R语言小提琴图(Violin Plot)及其绘制方法 在数据可视化中,箱线图是用来展示数据分布和离散程度的一种常用图表,它包含了中位数、上下四分位数和异常值等信息。然而,在某些情况下,箱线图可能无法充分展示数据的累积分布情况,无法揭示数据分布的更多细节。为了解决这个问题,小提琴图(Violin Plot)被提出并广泛应用。 什...
ggplot(df,aes(cut,x,color=cut))+ geom_flat_violin()+coord_flip()+ theme(legend.position="none") 输出: 示例4:水平半小提琴图,旁边有抖动的数据点 让我们来绘制一个半小提琴图以及抖动点。 R实现 # half violin plot with jittered points ggplot(df,aes(cut,x,fill=cut))+ geom_flat_violin(p...
Dots (or points) can be added to a violin plot using the functionsgeom_dotplot()orgeom_jitter(): # violin plot with dot plotp+geom_dotplot(binaxis='y',stackdir='center',dotsize=1)# violin plot with jittered points# 0.2 : degree of jitter in x directionp+geom_jitter(shap...
library(ggplot2) data(singer, package="lattice") ggplot(singer, aes(x=voice.part, y=height)) + geom_violin(fill="lightgreen") + geom_boxplot(fill="lightblue", width=.2) 实例二 本部分我们使用R基础安装中的mtcars数据框,它描述了34种车型的参数,包括每加仑可行使英里数(mpg)、变速箱类型(am...
Basic violin plot Building a violin plot with ggplot2 is pretty straightforward thanks to the dedicated geom_violin() function. # Library library(ggplot2) # create a dataset data <- data.frame( name=c( rep("A",500), rep("B",500), rep("B",500), rep("C",20), rep('D', 100...
# Inserted mean with the corresponding point shapes from original figure. Size versus the other points was increased so the mean is easily identified. stat_summary(fun.y=mean, geom="point", shape=c(16,15), size=3) 数据框如下所示: ...
title="Scatterplot with overlapping points", caption="Source: midwest") 上图中其实有很多点是重合的 原始数据是整数 1 dim(mpg) 用jitter_geom()画抖动图 重合的点在原先的位置基于一定阈值范围(width)随机抖动 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 library(ggplot2) data(mpg, package="ggplot2")...
1.2 带边界的散点图(Scatterplot With Encircling) 1.3 抖动图(Jitter Plot) 1.4 计数图(Counts Chart) 1.5 气泡图(Bubble Plot) 1.6 边际直方图/箱线图(Marginal Histogram / Boxplot) ...