ggplot(df,aes(cut,x,fill=cut))+ geom_flat_violin()+ theme(legend.position="none") 输出: 示例2:水平半小提琴情节 让我们看看使用 coord_flip() 函数水平对齐半小提琴图。 R实现 # Horizontal half violin plot ggplot(df,aes(cut,x,fill=cut))+ geom_flat_violin()+coord_flip()+ theme(legend....
("B", 10))) df library(ggplot2) library(ggprism) ggplot(data = df, aes(x = groups, y = value, fill = type)) + geom_violin(position = position_dodge(0.5))+ geom_boxplot(width=0.1, position = position_dodge(0.5))+ theme_prism()+ scale_fill_manual(values = c("#1c9e77","#...
最近看到很多人问下面这个图怎么绘制,看着确实不错。于是我查了一些资料,这个图叫split violin或者half violin,本质上是一种小提琴图。参考代码在https://gist.github.com/Karel-Kroeze/746685f5613e01ba820a31e57f87ec87 这里利用上期处理好的TCGA HNSCC的配对数据进行练习,数据包含43个肿瘤样本和43个癌旁样本。
geom_half_violin() 最近在一个介绍ggplot2扩展包的链接里发现了一个包叫see,这个包里有一个函数是geom_violindot()函数,画云雨图非常方便,下面简单介绍一下代码 首先是安装see这个R包 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 install.package("see") ...
geom_boxplot(width = 0.2, outlier.color = "red", alpha = 0.7) + # Enhanced axis labels and title for clarity and impact labs( x = 'Day', y = 'Time (seconds)', title = "Rorarod Performance Across Different Genotypes", subtitle = "Boxplot and half-eye plot visualization" ...
ggplot图的元素可以主要可以概括如下:最大的是plot(指整张图,包括background和title),其次是axis(包括stick,text,title和stick)、legend(包括backgroud、text、title)、facet这是第二层次,其中facet可以分为外部strip部分(包括backgroud和text)和内部panel部分(包括backgroud、boder和网格线grid,其中粗的叫grid.major,细...
aes(x=Half, y=Full)) + geom_point() + coord_fixed(ratio=1/2) 6 修改刻度的文本 在需要设置标签的地方同时为breaks和labels赋值即可。 1 2 librarygcookbook ggplot(height, aes(x=ageYear, y=heightIn)) + geom_point() + scale_y_continuous(breaks=c(50, 56, 60, 66, 72), labels...
geom_half_violin geom_half_point All of them have asideargument that can be eitherlfor left orrfor right half. As a special case there is alsogeom_half_dotplotto support half dotplots that dodge aesthetics such asfillandcolour. gghalvesalso works well with otherggplot2geoms and extensions ...
levels = variable) #排好序 ggplot(df)+ geom_half_violin(aes(as.numeric(factor(Species,levels = my_sort))+0.1, value,fill=factor(Species,levels = my_sort)), side = 'r',cex=0.8)+ #右侧半边显示 geom_boxplot(aes(as.numeric(factor(Species,levels = my_sort))+0.1, value,fill=factor...
于是我查了一些资料,这个图叫split violin或者half violin,本质上是一种小提琴图。参考代码在gist.github.com/Karel-K 这里利用上期处理好的TCGAHNSCC的配对数据进行练习,数据包含43个肿瘤样本和43个癌旁样本。 除了基因表达量绘制的结果展示,最后还附带一个ESTIMATE计算免疫评分的例子。此外,计算免疫浸润主流的方法...