在R语言中,ggplot2是一个强大的数据可视化包,它提供了丰富的图形类型和灵活的绘图功能。其中,geom_tile函数可以用来创建热图,但也可以用来创建与热图完全不同的图形。 geom_tile函数可以将数据映射到矩形的颜色和大小上,从而创建出热图。但是,如果我们改变了数据的映射方式,就可以得到与热图完全不同的图形效果...
首先是示例数据 image.png 使用R语言的ggplot2做一个热图 #install.packages("see") df<-read.csv("20210809_example.csv") library...(ggplot2) library(see) ggplot(data=df,aes(x=gene_name,y=variable))+ geom_tile(aes(fill=value))+ scale_fill_social_c...() image.png 增加y轴的上下空白 gg...
ggplot(df, aes(x, y)) + geom_tile(aes(fill = factor(z)), colour = "grey50", width = 2, height = 2)+ geom_vline(aes(xintercept=6),linetype="dashed",colour="red",size=1)+ geom_hline(aes(yintercept=24),linetype="dashed",colour="red",size=1)+ scale_x_continuous(expand ...
geom_area 线与x轴围成的区域 geom_path 点组成的路线图 geom_rect 绘制矩形 geom_raster 绘制矩形 geom_tile 绘制矩形 geom_polygon 绘制多边形 geom_bar 条形图(分组计数值) geom_col 条形图(数据值) geom_histogram 直方图 geom_boxplot 箱线图
geom_tile()函数绘制结果 plotnine.geoms.geom_smooth()函数 import pandas as pd import numpy as np from plotnine import ( ggplot, aes, geom_point, geom_smooth, labs ) from plotnine.data import mpg #可视化绘制 ( ggplot(mpg, aes(x='displ', y='hwy', color='factor(drv)')) + geom_point...
ggplot(data = data, aes(x = x, y = y, linetype = group)) + geom_line( 3、geom geom_blank:在图形中插入空白元素。 geom_curve:用于绘制平滑曲线。 geom_path:用于绘制点之间的连线。 geom_polygon:用于绘制多边形。 geom_rect:用于绘制矩形。
ggplot() + geom_tile(aes(x = Var1, y = Var2, fill = value)) + facet_wrap(vars(idx), scales = "free") } 请注意,上一张图和这张图之间的x-axis值不同。 这并不是说ggplot对re-scaled轴有根本问题。在这里,我单独绘制了先前图像的第三个面板,没有faceting. ...
ggplot2绘图系统——heatmap、geom_rect 这里不介绍更常见的pheatmap包。 1.heatmap函数 基础包。 2.geom_tile ggplot2 中,热图可看作若干个小矩形组成。其几何对象就是rect(矩形)或tile(瓦片),两者效果相同。
geom_text()可在指定点处添加标签 geom_tile()用来绘制色深图(image plot)或水平图(level plot) 使用以下代码绘制几何对象: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 >library(ggplot2) > df <-data.frame( + x=c(3,1,5), + y=c(2,4,6), ...
2.geom_tile ggplot2 中,热图可看作若干个小矩形组成。其几何对象就是rect(矩形)或tile(瓦片),两者效果相同。 mydata <- data.frame(year=2000:2015,lung=runif(16), liver=runif(16),bone=runif(16), luk=runif(16),eso=runif(16),gas=runif(16), ...