ggplot(data, aes(x, y, fill = value)) + geom_tile() 在上述示例中,我们创建了一个数据框data,包含了x、y坐标和value值。然后使用ggplot()函数创建一个绘图对象,并使用aes()函数设置填充颜色的变量为value。最后使用geom_tile()函数绘制矩形图。
ggplot2是R语言中一种常用的数据可视化包,而geom_tile是ggplot2中的一种几何对象,用于创建瓦片图。瓦片图是一种二维图形,通过不同颜色或填充来表示数据的值。 使用ggplot2的geom_tile函数可以控制瓦片的半径,具体来说,可以通过调整瓦片的宽度和高度来改变瓦片的半径大小。通过设置不同的宽度和高度,可以创建不同大小...
d + stat_density2d(geom = "tile", aes(fill = ..density..),contour = F) last_plot() + scale_fill_gradient(limits = c(1e-5,8e-4)) 4.曲面图 ggplot2不支持真正的三维曲面图。但具有在二维平面上展现三维曲面的常见工具:等高线图,着色瓦片(colored tiled)以及气泡图。 真实的三维绘制建议关注...
3 栅格数据框 类似栅格的非空间数据框可以使用geom_raster()函数或geom_tile()函数绘制: data = data.frame( rastertemp$tavg_04, x = crds(rastertemp)[,1], y = crds(rastertemp)[,2] ) ggplot(data) + geom_raster(aes(x,y, fill = tavg_04)) +scale_fill_gradient(low = "#FFFFCC", h...
ggplot(data=diamonds,aes(x=price,y=..density..))+geom_freqpoly(aes(color=cut),binwidth=500) 密度-折线图 3、异常值观测 当条形图出现极大、极小值时,极小值的直方图因为比例原因几乎难以观察; ggplot(diamonds, aes(x = y)) + geom_histogram(binwidth = 0.5) ...
2.geom_tile ggplot2 中,热图可看作若干个小矩形组成。其几何对象就是rect(矩形)或tile(瓦片),两者效果相同。 mydata <- data.frame(year=2000:2015,lung=runif(16), liver=runif(16),bone=runif(16), luk=runif(16),eso=runif(16),gas=runif(16), ...
ggplot2绘图系统——heatmap、geom_rect 这里不介绍更常见的pheatmap包。 1.heatmap函数 基础包。 2.geom_tile ggplot2 中,热图可看作若干个小矩形组成。其几何对象就是rect(矩形)或tile(瓦片),两者效果相同。
library(readxl)df5<-read_excel("Cor/exampledf.xlsx",sheet="Sheet5")df5library(ggplot2)ggplot()+geom_tile(data=df5,aes(x=x,y=y),fill="white",color="grey") image.png 如果是画三角热图示例数据如下 image.png 这种是宽格式数据,读取数据然后转换为长格式 ...
geom_hline 水平线 geom_vline 垂直线 geom_area 线与x轴围成的区域 geom_path 点组成的路线图 geom_rect 绘制矩形 geom_raster 绘制矩形 geom_tile 绘制矩形 geom_polygon 绘制多边形 geom_bar 条形图(分组计数值) geom_col 条形图(数据值) geom_histogram 直方图 ...
(data) #对数据进行融合,适应ggplot的数据结构,以进行热图的绘制colnames(dp) <- c("Gene","Sample","Value")p<- ggplot(dp, aes(Sample,Gene)) + geom_tile(aes(fill =as.factor(Value)))+theme(axis.text.x=element_text(angle =90))+ guides(fill = guide_legend(title ="Copy Number")) +...