首先是示例数据 image.png 使用R语言的ggplot2做一个热图 #install.packages("see") df<-read.csv("20210809_example.csv") library...(ggplot2) library(see) ggplot(data=df,aes(x=gene_name,y=variable))+ geom_tile(aes(fill=value))+ scale_fill_social_c...() image.png 增加y轴的上下空白 gg...
在R语言中,ggplot2是一个强大的数据可视化包,它提供了丰富的图形类型和灵活的绘图功能。其中,geom_tile函数可以用来创建热图,但也可以用来创建与热图完全不同的图形。 geom_tile函数可以将数据映射到矩形的颜色和大小上,从而创建出热图。但是,如果我们改变了数据的映射方式,就可以得到与热图完全不同的图形效果...
ggplot() + geom_tile(aes(x=x, y=y, fill = value)) + facet_wrap("idx")
hclust聚类,改变矩阵行列顺序为聚类后的顺序 melt数据,处理成ggplot2能够直接处理的数据结构,并加上列名 ggplot_tile进行画图 gplots 数据处理成矩阵形式,给行名列名 调制颜色并用heatmap.2画热图(heatmap.2函数内部用hclustfun 进行聚类) R语言代码 library(pheatmap)library(data.table)CN_DT<- fread("/home/ywl...
(data) #对数据进行融合,适应ggplot的数据结构,以进行热图的绘制colnames(dp) <- c("Gene","Sample","Value")p<- ggplot(dp, aes(Sample,Gene)) + geom_tile(aes(fill =as.factor(Value)))+theme(axis.text.x=element_text(angle =90))+ guides(fill = guide_legend(title ="Copy Number")) +...
geom_hline 水平线 geom_vline 垂直线 geom_area 线与x轴围成的区域 geom_path 点组成的路线图 geom_rect 绘制矩形 geom_raster 绘制矩形 geom_tile 绘制矩形 geom_polygon 绘制多边形 geom_bar 条形图(分组计数值) geom_col 条形图(数据值) geom_histogram 直方图 ...
ggplot(data = data, aes(x = x, y = y, color = group)) + geom_point() 绘制折线图 ggplot(data = data, aes(x = x, y = y, color = group)) + geom_line() 绘制柱状图 ggplot(data = data, aes(x = group, y = y, fill = group)) + geom_bar(stat = "identity") ...
geom_text中,使用expression类型的输入会报警告(无论是否有parse=T),但仍可在图像上画出数学符号(ggplot2 v.3.4.2),这是个底层R的bug,目前并不会影响ggplot2画图,但也没有修复计划。可选解决办法是,直接用字符型,然后设置parse=T(注意仅在geom_text中这么用),例如:建议用geom_text(label="''^210*Pb[ex...
2019-12-18 16:10 − 简单记录tile和repeat的功能 np.tile(A,reps) A: 输入数组 reps: 重复数,list类型,分别表示axis=0, axis=1,...方向上的重复数 array的axis表示如下: 2... Zachary_Cai 0 4 ggplot2|玩转Manhattan图-你有被要求这么画吗? 2019-12-11 10:21 − 本文首发于“生信补给站”...
R语言 将ggplot2 geom_tile中的切片细分为四分之一一种选择是使用刻面，即Var1和Var2的刻面，在“x...