flirt [options] -in -ref <refvol> -applyxfm -init <matrix> -out 这里提供了三种方式,终端输入flirt可以查看使用说明 我们首先使用第一种flirt -in T1W_brain.nii.gz -ref T2W_brain.nii.gz -out register1.nii.gz -dof 6 -c...
先打开fsl > 点击B按钮,出现CD区,在C中输入 reference image(我的T2w对比度好些,用它做参考图像), DOF(自由度)选择刚体变换,6个自由度。设置输入输出图像地址。D区中的高级选项可以设置代价函数和插值方式,这里我用默认的就行。 使用命令行 flirt [options] -in -ref <refvol> -out flirt [options] -...
#该命令将T1加权大脑图像配准到标准MNI152大脑模板,建立了一个变换矩阵(` test1.mat ` ).t1图像到模板的坐标空间 /home/ding/fsl/bin/flirt -in /home/ding/Desktop/HCS/FMRI/FMRI.nii -ref /home/ding/Desktop/HCS/T1_BRAIN/T1_BRAIN.gz -omat /home/ding/Desktop/test2.mat -bins 256 -cost corrat...