首先敲一下fastqc –h看装好了吗! FastQC - A high throughputsequence QC analysis tool SYNOPSIS fastqc seqfile1 seqfile2 .. seqfileN fastqc [-o output dir] [--(no)extract] [-ffastq|bam|sam] [-c contaminant file] seqfile1 ..seqfileN DESCRIPTION FastQC reads a set of sequence files a...
-h --help打印此帮助文件并退出 -v --version打印程序的版本并退出 -o --outdir在指定的输出目录中创建所有输出文件。请注意,该目录必须存在,因为程序不会创建该目录。如果未设置此选项,则将在与已处理序列文件相同的目录中创建每个序列文件的输出文件 ...
h) usage exit 1 ;; d) fastq_dir=${OPTARG} ;; esac done if [ ! -d "${fastq_dir}/fastqc" ]; then mkdir "${fastq_dir}/fastqc" fi cd "${fastq_dir}/" fastqc *fastq.gz -t 2 --outdir "${fastq_dir}/fastqc" && multiqc "${fastq_dir}/fastqc" --verbose --module fastqc -...
华为云将持续创新,携手客户、合作伙伴和开发者,致力于让云无处不在,让智能无所不及,共建智能世界云底座。 [免费体验中心]免费领取体验产品,快速开启云上之旅免费 华为云服务器之间快速传文件夹 更多内容 创建FastQC应用样例 填写所需的输入参数。 图6 输入参数 填写所需的输出参数。 因镜像启动命令中指定了输出参...
drpatelh added this pull request to the merge queue May 30, 2023 View details Merged via the queue into nf-core:master with commit 48dbb40 May 30, 2023 10 checks passed drpatelh deleted the fastp branch January 9, 2024 21:44 Sign up for free to join this conversation on GitHub...
面向未来的智能世界,数字化是企业发展的必由之路。数字化成功的关键是以云原生的思维践行云原生,全数字化、全云化、AI驱动,一切皆服务。 华为云将持续创新,携手客户、合作伙伴和开发者,致力于让云无处不在,让智能无所不及,共建智能世界云底座。 [免费体验中心]免费领取体验产品,快速开启云上之旅免费 ...