访问FastQC官方网站: 打开浏览器,访问FastQC官方网站。 下载适用于Windows系统的FastQC安装程序: 在FastQC官方网站上,找到并点击“Download Now”按钮。 在下载页面,向下滚动找到适用于Windows的版本,并下载对应的ZIP压缩包。 运行下载的安装程序: 下载完成后,解压ZIP压缩包到一个方便访问的目录,例如C:\Program File...
fastqc 样本1 样本2 … -o 文件夹 下载安装包 在网站上选择对应的下载入口: http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/download.html#fastqc, 点击进行下载,获得了一个压缩包fastqc_v0.11.9.zip。 首先进行解压缩,运行命令unzip fastqc_v0.11.9.zip。 解压缩后生成了一个名为FastQC的文件夹,cd Fas...
2. 下载FastQC的安装文件。你可以在FastQC的官方网站(http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/)上找到适用于Linux系统的安装文件。 在终端上,使用wget命令下载安装文件。例如,下载FastQC v0.11.9的安装文件(根据具体版本号进行修改): “`bash wgethttps://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/proj...
Fastqc安装中可能遇到的问题 一、安装JAVA环境 这一步个人并非按照xiaoming老师的步骤所做,而是直接输入sudo apt-get install default-jre完成,因为并不确定该方法是否会造成某些问题,大家姑且当做优先级较低的那一个吧 二、FastQC的安装 step 1:下载安装包 输入wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projec...
$ fastqc-o./-t1Sample.R1.fastq.gz $lsSample.R1.fastq.gz Sample.R1.fastqc.zip Sample.R1.fastqc.html 下载html到本地可以用浏览器打开即可看到质控分析结果。 如果在流程中可以从Sample.R1.fastqc/fastqc_data.txt文件中读取数据。 同时输出的html的报告支持修改格式,可以替换为自己的模板。修改安装路径...
一、安装java环境 已经安装好了 需要权限 二、fastqc安装 cd ~/Biosofts #进入目录 进入目录 wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.7.zip #通过链接下载 复制链接获取压缩包 mkdir ~/Biosofts/fastqc #创建文件夹 ...
FastQC 是一个 Java 应用程序,为了运行它需要首先需要下载一个合适的了 Java 运行环境 (JRE)。如果不确定电脑上是否已经安装了Java,可以在终端输入: java --version 出现版本信息则说明已经安装过了。 对于Windows和Mac用户,可以直接到FastQC的官方网站(https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/)...
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FastQC是一款广泛使用的用于分析DNA测序数据质量的软件,可以帮助用户快速准确地评估测序数据的质量。在Linux操作系统下安装FastQC也是相对简单的,只需按照以下步骤进行操作即可。 首先,在Linux系统下打开终端,输入以下命令以下载FastQC软件: ``` wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v...
Linux下安装Java环境配置步骤详述- TopCoderの陳澤澤 一、下载安装FastQC软件 注意:fastqc是一个java软件,需要自行配置好java环境,下载后可直接使用。 A. Liunx下配置java环境。 1.首先在官网上下载Linux 64位的Java SE Development Kit 8(Java SE开发工具包)。根据自己的系统版本来选择是要使用32位版还是64位版。