1. 检查Linux系统是否已安装fastqc软件 首先,在终端中输入以下命令来检查FastQC是否已安装: bash fastqc -h 如果系统显示FastQC的帮助信息,则说明FastQC已经安装。如果系统提示“command not found”或其他错误信息,则说明需要安装FastQC。 2. 更新软件包列表 如果确定需要安装FastQC,首先更新软件包列表。这一步对于使用...
你可以在FastQC的官方网站(http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/)上找到适用于Linux系统的安装文件。 在终端上,使用wget命令下载安装文件。例如,下载FastQC v0.11.9的安装文件(根据具体版本号进行修改): “`bash wgethttps://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11....
从FastQC官网下载FsatQC文件,选择对应的Linux版本。可以在Linux系统中下载,也可以在windows系统中下载,然后复制粘贴到Linux中。 2.2 FastQC文件安装 FastQC软件可以直接安装。 sudo apt-get install fastqc 打开FastQC软件,终端输入fastqc。 fastqc 出现如下图所示,则说明fastqc软件安装成功。
unzip fastqc_v0.11.9.zip cd FastQC ``` 然后,赋予FastQC可执行权限: ``` chmod +x fastqc ``` 接下来,输入以下命令以运行FastQC: ``` ./fastqc ``` 此时,FastQC界面将会出现在屏幕上,您可以根据软件提供的选项和指引对测序数据进行质量分析。 通过上述几个简单的步骤,您就可以在Linux系统下成功安装并运...
Linux安装运⾏Fastqc 1.从官⽹下载FastQC 2.解压⽂件，并进⼊该⽂件 将其⾄于某个⽂件夹，unzip fastqc_v0.11.5.zip.3.进⼊解压⽬录，设置可执⾏权限 chmod u+x fastqc #chmod 754 fastqc 4.配置环境变量 vim ~/.bashrc export PATH=$PATH:/home/zhou/bio_solfware/FastQC/ # 添加...
在Linux上安装FastQC具体过程如下: 创建一个名为“Biosofts”的文件夹 mkdir Biosofts 进入“Biosofts”文件夹 cd ~/Biosofts 从官方下载网站下载FastQC的最新版本 wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.12.1.zip
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一、下载安装FastQC软件 注意:fastqc是一个java软件,需要自行配置好java环境,下载后可直接使用。 A. Liunx下配置java环境。 1.首先在官网上下载Linux 64位的Java SE Development Kit 8(Java SE开发工具包)。根据自己的系统版本来选择是要使用32位版还是64位版。Linux提供了两种安装方式一个是.rpm,另一个是.tar...
Linux 安装运行Fastqc > 日一二三四五六 1234567 891011121314 15161718192021 22232425262728 2930311234 567891011 统计 1.从官网下载FastQC https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ 2.解压文件,并进入该文件 将其至于某个文件夹,unzip fastqc_v0.11.5.zip....
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