中文名称:NA结合模体 英文名称:DNA-binding motif 定义:DNA结合蛋白中与DNA发生相互作用的区域所具有的特定的结构模式。如锌指结构、亮氨酸拉链、螺旋-转角-螺旋、螺旋-环-螺旋等。 应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
^Doherty AJ, Serpell LC, Ponting CP. The helix-hairpin-helix DNA-binding motif: a structural basis for non-sequence-specific recognition of DNA. Nucleic Acids Res. 1996 Jul 1;24(13):2488-97. ^Ling C, et al. Bloom syndrome complex promotes FANCM recruitment to stalled replication forks an...
Prendergast,GC,Ziff,EB.DNA-binding motif.Nature. 1989G.C. Prendergast, E.B. Ziff, DNA binding motif, Nature, 341 (1989) 392.DNA-binding motif. Prendergast,GC,Ziff,EB. Nature . 1989Prendergast GC, Ziff EB. DNA-binding motif [letter]. Nature 1989; 341: 392....
专业医学词典 DNA结合基序 与"DNA binding motif"相近的词条 ...
A novel DNA-binding domain that may form a single zinc finger motif. S. Yanagisawa, A novel DNA-binding domain that may form a single zinc finger motif, Nucleic Acids Res. 23 (1995) 3403-3410... S,Yanagisawa - 《Nucleic Acids Research》 被引量: 217发表: 1995年 A gene from the huma...
转录因子的结合位点(transcription factor binding site,TFBS)是转录因子调节基因表达时,与mRNA结合的区域.按照常识,转录因子(transcription factor,TF)的结合位点一般应该分布在基因的前端,但是,新的研究发现,人21和22号染色体上,只有22%的转录因子结合位点分布在蛋白编码基因的5'端. 这篇文章的试验方法是,通过高密度...
有趣的是,USF的DNA结合位点特征(DNA binding motif)非常相似,而且富含鸟嘌呤(Guanine)。 小鼠B淋巴细胞的转录因子共定位热图。 为了探索USF的功能,作者利用CRISPR技术对不同的USF进行了单基因敲除和不同组合基因敲除。整体上,被敲除的USF...
有趣的是,USF的DNA结合位点特征(DNA binding motif)非常相似,而且富含鸟嘌呤(Guanine)。 小鼠B淋巴细胞的转录因子共定位热图。 为了探索USF的功能,作者利用CRISPR技术对不同的USF进行了单基因敲除和不同组合基因敲除。整体上,被敲除的USF基因数量越多,染色质开放性(chromatin accessibility)显著受影响的调控区域越多,...
认为strand-1无意义,估计是考虑到如果motif的方向反了,TF的方向也跟着反了,调控的不就是相反方向的基因了? 事实上是这样的吗? 高中物理老师告诉我们:你想的都是错的,只有算过才是对的。 2016年发表在BMC Genomics上的文章已经算过了。 The orientation of transcription factor binding site motifs in gene prom...
作者观察到,大多数点边界都由两个或多个CTCF+cohesin-binding motifs构成,这些motif以聚合或发散方向排列(图1c)。当点边界与早期复制IZs共定位时,这个分子特征将会进一步强化。相反,几乎所有的无点边界仅包含一个或没有CTCF+cohesion-bound motifs(图1c...