转录因子的结合位点(transcription factor binding site,TFBS)是转录因子调节基因表达时,与mRNA结合的区域.按照常识,转录因子(transcription factor,TF)的结合位点一般应该分布在基因的前端,但是,新的研究发现,人21和22号染色体上,只有22%的转录因子结合位点分布在蛋白编码基因的5'端. 这篇文章的试验方法是,通过高密度...
专业医学词典 DNA结合基序 与"DNA binding motif"相近的词条 ...
(1)以α螺旋的形式嵌入到DNA大沟中,如原核生物中的HTH,以及真核生物中较常见的四类DNA结合结构域:锌指结构,亮氨酸拉链,HLH(螺旋-环-螺旋),同源异型域;(2)大量的调节蛋白在进化上有另外一个完全不同的识别策略,即利用双链的ß-sheet与DNA结合,以一对反平行折叠插入到DNA中,例如细菌Met受体,当SAM大量存在...
有趣的是,USF的DNA结合位点特征(DNA binding motif)非常相似,而且富含鸟嘌呤(Guanine)。 小鼠B淋巴细胞的转录因子共定位热图。 为了探索USF的功能,作者利用CRISPR技术对不同的USF进行了单基因敲除和不同组合基因敲除。整体上,被敲除的USF基因数量越多,染色质开放性(chromatin accessibility)显著受影响的调控区域越多,...
（2）DMC/DMR转录因子结合分析（TF binding motif ）主要关注Promoter和Enhancer等调控区域DMC/DMR的TF...
DNA binding domains reflects the need of the factors which contain them to bind to distinct types ofDNA sequences. Rather, it seems perfectly possible that oneDNA binding motifcould be present in all factors with variations of it in different factors producing the observed binding to different ...
A novel DNA-binding domain that may form a single zinc finger motif. S. Yanagisawa, A novel DNA-binding domain that may form a single zinc finger motif, Nucleic Acids Res. 23 (1995) 3403-3410... S,Yanagisawa - 《Nucleic Acids Research》 被引量: 217发表: 1995年 A gene from the huma...
首先进行差异甲基化位点/区域分析（DMC/DMR分析），包括DMC/DMR鉴定、DMC/DMR转录因子结合分析（TF binding motif）、时序甲基化数据的分析策略、DMC/DMR在基因元件上的分布等。接着，对差异甲基化基因（DMG)的功能进行分析，研究DMG在GO term和KEGG pathway中的富集情况，以便理解受甲基化调控的细胞功能...
DNA-binding motif and target genes of the imprinted transcription factor PEG3 PEG3 binds specific genomic target regions through its consensus DNA-binding motif AGTnnCnnnTGGCT. PEG3 functions as a DNA-binding transcription factor co... MM Thiaville,JM Huang,H Kim,... - 《Gene》 被引量: ...